RNA–Protein interactions for RNA: YKR078W

YKR078W, Transcript of Cytoplasmic protein of unknown function, yeast

Gene YKR078W, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR078W	YKR078W	GUP1	P53154	560 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YKR078W	YKR078W	FUS1	P11710	512 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR078W	YKR078W	QDR1	P40475	563 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR078W	YKR078W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YKR078W	YKR078W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKR078W	YKR078W	PAN5	P38787	379 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YKR078W	YKR078W	LEM3	P42838	414 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YKR078W	YKR078W	DSE4	P53753	1117 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YKR078W	YKR078W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	ATG1	P53104	897 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	ACF4	P47129	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	GLO4	Q12320	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	RSC6	P25632	483 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	YJR124C	P47159	448 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
YKR078W	YKR078W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	CTR9	P89105	1077 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	RSC4	Q02206	625 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	UFD2	P54860	961 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	GEF1	P37020	779 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	NEO1	P40527	1151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	MNL2	Q12205	849 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	COB	P00163	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	ERP5	P38819	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	MDJ2	P42834	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	YNL011C	P53980	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	REC8	Q12188	680 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR078W	YKR078W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	COQ2	P32378	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	DUR3	P33413	735 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	ELG1	Q12050	791 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	NCE103	P53615	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	HAT1	Q12341	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	KAE1	P36132	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	SAF1	P38352	637 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	FET4	P40988	552 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	ERS1	P17261	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	RIM11	P38615	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	TRP3	P00937	484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	MAC1	P35192	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	OMA1	P36163	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	AKR1	P39010	764 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	INP52	P50942	1183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
YKR078W	YKR078W	NPR1	P22211	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	CDC55	Q00362	526 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	FRT1	Q99332	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	BSC2	Q05611	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	NUT2	Q06213	157 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	FLP1	P03870	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	CHS2	P14180	963 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	YKR073C	P36153	106 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	FAR11	P53917	953 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	MED7	Q08278	222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	YHL008C	P38750	627 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	YGR130C	P53278	816 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR078W	YKR078W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	SAP155	P43612	1002 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	NUT1	P53114	1132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	GIC2	Q06648	383 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	YIG1	Q08956	461 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	SPO74	P45819	413 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	TOS1	P38288	455 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	CTH1	P47976	325 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	GCV1	P48015	400 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
YKR078W	YKR078W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	CYC7	P00045	113 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	GPT2	P36148	743 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	YHL050C	P38721	697 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	YHR219W	P38900	624 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	YAF9	P53930	226 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	MEC3	Q02574	474 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	PMT7	Q06644	662 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKR078W	YKR078W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.7 ms