RNA–Protein interactions for RNA: YJR087W

YJR087W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJR087W, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJR087W	YJR087W	RRM3	P38766	723 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	SOG2	Q08817	791 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	BUD9	P53226	547 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	ALD3	P54114	506 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	TED1	P40533	473 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	PRY1	P47032	299 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	DSE4	P53753	1117 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	CDC55	Q00362	526 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	SAC7	P17121	654 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	SFA1	P32771	386 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	BSC2	Q05611	235 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	MNL2	Q12205	849 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	AI3	P03877	415 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	TFA2	P36145	328 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	SPO71	Q03868	1245 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	NUT2	Q06213	157 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	YHL050C	P38721	697 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	PAN5	P38787	379 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	YHR219W	P38900	624 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	NEO1	P40527	1151 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	YJR124C	P47159	448 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	CTR9	P89105	1077 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	GLO4	Q12320	285 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	FRT1	Q99332	602 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	RSC6	P25632	483 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	YHL008C	P38750	627 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	FET4	P40988	552 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	LSB6	P42951	607 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	SAM37	P50110	327 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	YNR065C	P53751	1116 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	HVG1	P0CE11	249 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	GAS5	Q08193	484 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	MCA1	Q08601	432 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	YPL034W	Q03083	165 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	FLP1	P03870	423 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	SEC20	P28791	383 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	SLD2	P34252	453 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	PPX1	P38698	397 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	MSH6	Q03834	1242 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	GPI13	Q07830	1017 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	NPR1	P22211	790 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	RIM11	P38615	370 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	FAR11	P53917	953 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	PMT7	Q06644	662 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	ELG1	Q12050	791 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	COB	P00163	385 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	YLL054C	Q12244	843 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YJR087W	YJR087W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	SAP155	P43612	1002 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	NUT1	P53114	1132 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	COQ2	P32378	372 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	DUR3	P33413	735 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	VPS35	P34110	944 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	THI12	P42883	340 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	THI5	P43534	340 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	THI11	P47183	340 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	YCS4	Q06156	1176 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	THI13	Q07748	340 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	GCV1	P48015	400 aa		5.31	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	YMR074C	Q04773	145 aa		5.31	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	YIG1	Q08956	461 aa		5.31	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	NCE103	P53615	221 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	YAF9	P53930	226 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	REC8	Q12188	680 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	ERS1	P17261	260 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	MET4	P32389	672 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	SHU2	P38957	223 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	IPL1	P38991	367 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	MON1	P53129	644 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	OXR1	Q08952	273 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	YOR223W	Q12015	292 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
YJR087W	YJR087W	YKL077W	P36081	392 aa		5.28	□□□□□ -1.56

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.2 ms