RNA–Protein interactions for RNA: YGL063C-A

YGL063C-A, Transcript of Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, yeast

Gene YGL063C-A, Length 150 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL063C-A	YGL063C-A	THI3	Q07471	609 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	IRC10	Q08118	586 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	RGT1	P32862	1170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	SKP2	P42843	763 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	YNL115C	P53925	644 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	YRR1	Q12172	810 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	DIT2	P21595	489 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	URK1	P27515	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	HEH2	Q03281	663 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
YGL063C-A	YGL063C-A	SYN8	P31377	255 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	PTC4	P38089	393 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	YBL028C	P38202	106 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	SGM1	P47166	707 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
YGL063C-A	YGL063C-A	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
YGL063C-A	YGL063C-A	INP52	P50942	1183 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	FCP1	Q03254	732 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	VPS72	Q03388	795 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	SRC1	Q03707	834 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	NSE3	Q05541	303 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	DUS4	Q06063	367 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	PSF3	Q12146	194 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	RTP1	Q12751	981 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YGL063C-A	YGL063C-A	SWI1	P09547	1314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	UGA3	P26370	528 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	FKH1	P40466	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	YAF9	P53930	226 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	SPO71	Q03868	1245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	EAF1	Q06337	982 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	SWI6	P09959	803 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	KEX2	P13134	814 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	YUR1	P26725	428 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	NPL4	P33755	580 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	GPT2	P36148	743 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	RTG3	P38165	486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	UBX5	Q06682	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	BET2	P20133	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	PER1	P25625	357 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	GPB2	P39717	880 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	MET13	P53128	600 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	YNL034W	P53963	612 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	YNL018C	P53976	612 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	YLR271W	Q06152	274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	PIN2	Q12057	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	SEG2	P34250	1132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	NTH2	P35172	780 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	BRL1	P38770	471 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	APL6	P46682	809 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	VPS53	P47061	822 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	POL3	P15436	1097 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	HCM1	P25364	564 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	COQ8	P27697	501 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	YFH7	P43591	353 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	BBC1	P47068	1157 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	FAP1	P53971	965 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	FMP27	Q06179	2628 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YGL063C-A	YGL063C-A	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YGL063C-A	YGL063C-A	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YGL063C-A	YGL063C-A	SLA1	P32790	1244 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YGL063C-A	YGL063C-A	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YGL063C-A	YGL063C-A	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YGL063C-A	YGL063C-A	YKR018C	P36114	725 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YGL063C-A	YGL063C-A	ARP1	P38696	384 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YGL063C-A	YGL063C-A	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YGL063C-A	YGL063C-A	SPO74	P45819	413 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YGL063C-A	YGL063C-A	ERG12	P07277	443 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YGL063C-A	YGL063C-A	MDL2	P33311	773 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YGL063C-A	YGL063C-A	POA1	P38218	177 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YGL063C-A	YGL063C-A	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YGL063C-A	YGL063C-A	SLD5	Q03406	294 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YGL063C-A	YGL063C-A	PEX19	Q07418	342 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YGL063C-A	YGL063C-A	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.3 ms