RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	SFI1	Q12369	946 aa		5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	MET1	P36150	593 aa		5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	RRM3	P38766	723 aa		5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	CSI1	Q04368	295 aa		5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	OSW2	Q12202	724 aa		5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	DCD1	P06773	312 aa		5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	FYV10	P40492	516 aa		5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	STU2	P46675	888 aa		5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	YGL140C	P53120	1219 aa		5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	YLR287C	Q05881	355 aa		5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	NKP2	Q06162	153 aa		5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	YBL086C	P38177	466 aa		5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	YSP2	Q06681	1438 aa		5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	YBL036C	P38197	257 aa		5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	SRT1	Q03175	343 aa		5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	EDE1	P34216	1381 aa		5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	YBL028C	P38202	106 aa		5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	GTT3	P39996	337 aa		5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	GDE1	Q02979	1223 aa		5.43	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	YML133C	Q03099	1374 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	YLL067C	Q07888	1374 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	YLL066C	Q99208	1374 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	COQ4	O13525	335 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	PET123	P17558	318 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	NTH2	P35172	780 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	GPT2	P36148	743 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	GEF1	P37020	779 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	TBS1	P38114	1094 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	UFD2	P54860	961 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.42	□□□□□ -1.54	not detected
DNF2	YDR093W	PHM7	Q12252	991 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	GCN2	P15442	1659 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	CWH41	P53008	833 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	EST2	Q06163	884 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	TIP41	Q12199	356 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	PTH2	P34222	208 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	NDC80	P40460	691 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	THI22	Q06490	572 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	RTT109	Q07794	436 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	RPC53	P25441	422 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	POL32	P47110	350 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	SPO21	Q12411	609 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	RSF2	P46974	1380 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	SPO22	P40511	975 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	APL6	P46682	809 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	PUS6	P53294	404 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	MTC5	Q03897	1148 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	TRK1	P12685	1235 aa		5.4	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SWC3	P31376	625 aa		5.4	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	MRE11	P32829	692 aa		5.4	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	YTA6	P40328	754 aa		5.4	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	YCG1	Q06680	1035 aa		5.4	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	TAF10	Q12030	206 aa		5.4	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	CLB1	P24868	471 aa		5.4	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	MAL31	P38156	614 aa		5.4	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	OPY1	P38271	328 aa		5.4	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	TBF1	Q02457	562 aa		5.4	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SPO16	P17122	198 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SRB4	P32569	687 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.39	□□□□□ -1.55	RIP-Chip
DNF2	YDR093W	NNF1	P47149	201 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	TIM50	Q02776	476 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	MDM38	Q08179	573 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	IML1	P47170	1584 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	PPX1	P38698	397 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SPC72	P39723	622 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	DSN1	P40568	576 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	YGL242C	P53066	181 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SEY1	Q99287	776 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	ERG12	P07277	443 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	URB2	P47108	1174 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	HOP2	P53187	214 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55

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