RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	YFL066C	P43538	392 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	CWH41	P53008	833 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	IQG1	Q12280	1495 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	SUV3	P32580	737 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	DRS2	P39524	1355 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	MMS1	Q06211	1407 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	KAP122	P32767	1081 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	MSC7	P38694	644 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	CAB1	Q04430	367 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	YML083C	Q04526	418 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	SRB8	P25648	1427 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	QDR2	P40474	542 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	SKP1	P52286	194 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CPR4	YCR069W	DOP1	Q03921	1698 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	RLF2	Q12495	606 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	YNR014W	P53719	212 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	HEH2	Q03281	663 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	PUN1	Q06991	263 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	RPC31	P17890	251 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	MRPL33	P20084	86 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	YBR197C	P38306	217 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	TDA6	Q06466	467 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	VMA3	P25515	160 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	APM2	P38700	605 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	YNR040W	P53736	256 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	SRS2	P12954	1174 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	ISC10	P32645	267 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	MET1	P36150	593 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	BOI2	P39969	1040 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	PRK1	P40494	810 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	YSP2	Q06681	1438 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.37
CPR4	YCR069W	DYS1	P38791	387 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	BNI1	P41832	1953 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	YMR187C	Q03236	431 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	BNR1	P40450	1375 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.44	□□□□□ -1.38	not detected
CPR4	YCR069W	LDH1	P38139	375 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	YOR296W	Q08748	1289 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	GCN2	P15442	1659 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	ITC1	P53125	1264 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	PNP1	Q05788	311 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	SSM4	P40318	1319 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	GIP1	P38229	639 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	BSD2	P38356	321 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	SKN7	P38889	622 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	IDI1	P15496	288 aa		6.4	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	ALG14	P38242	237 aa		6.4	□□□□□ -1.38
CPR4	YCR069W	HAP1	P0CE41	1502 aa		6.4	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	DNF2	Q12675	1612 aa		6.39	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	YDR215C	Q12240	137 aa		6.39	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	NHA1	Q99271	985 aa		6.39	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	MRP10	O75012	95 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	MSN1	P22148	382 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	6.38	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	RRN6	P32786	894 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	ISW1	P38144	1129 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	GIS4	Q04233	774 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	6.38	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	6.37	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	HXT8	P40886	569 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	APC11	Q12157	165 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	KTR2	P33550	425 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	PAF1	P38351	445 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	BOL3	P39724	118 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	FIR1	P40020	876 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	YIL165C	P40446	119 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	PRY1	P47032	299 aa		6.34	□□□□□ -1.39

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