RNA–Protein interactions for RNA: YBR194W

AIM4, Transcript of Protein proposed to be associated with the nuclear pore complex, yeast

Gene AIM4, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM4	YBR194W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	CTR9	P89105	1077 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	FUS1	P11710	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	SFA1	P32771	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	ERP5	P38819	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	MDJ2	P42834	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	UFD2	P54860	961 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	GAS5	Q08193	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	MCA1	Q08601	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	RRM3	P38766	723 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	TED1	P40533	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	LEM3	P42838	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	GLO4	Q12320	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	TAT1	P38085	619 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	LSB6	P42951	607 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	COB	P00163	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	SAC7	P17121	654 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	DUR3	P33413	735 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	YNL011C	P53980	444 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	HAT1	Q12341	374 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	PAN5	P38787	379 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	YJR124C	P47159	448 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	FRT1	Q99332	602 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	RIM11	P38615	370 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	DSE4	P53753	1117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	CDC55	Q00362	526 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	NUT2	Q06213	157 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	SAP155	P43612	1002 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	FLP1	P03870	423 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	RSC6	P25632	483 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	NCE103	P53615	221 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	REC8	Q12188	680 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	NPR1	P22211	790 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	NEO1	P40527	1151 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	FET4	P40988	552 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	BSC2	Q05611	235 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	ELG1	Q12050	791 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AIM4	YBR194W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	ERS1	P17261	260 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	YHL050C	P38721	697 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	YHR219W	P38900	624 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	NUT1	P53114	1132 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
AIM4	YBR194W	YIG1	Q08956	461 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	SAF1	P38352	637 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	PPX1	P38698	397 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	YHL008C	P38750	627 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	MET4	P32389	672 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	GCV1	P48015	400 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	FAR11	P53917	953 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	YAF9	P53930	226 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	TRP3	P00937	484 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	COQ2	P32378	372 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	KAE1	P36132	386 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	SAM37	P50110	327 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	INP52	P50942	1183 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	MEC3	Q02574	474 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	PMT7	Q06644	662 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AIM4	YBR194W	VPS35	P34110	944 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AIM4	YBR194W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
AIM4	YBR194W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
AIM4	YBR194W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
AIM4	YBR194W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
AIM4	YBR194W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
AIM4	YBR194W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AIM4	YBR194W	YKR073C	P36153	106 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AIM4	YBR194W	AKR1	P39010	764 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AIM4	YBR194W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AIM4	YBR194W	WHI5	Q12416	295 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AIM4	YBR194W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
AIM4	YBR194W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AIM4	YBR194W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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