RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626257.2

CCZ1B-215, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, human

TSL 2 BASIC

Gene CCZ1B, Length 2,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCZ1B-215	ENST00000626257	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		33.94	■■■■□ 3.02
CCZ1B-215	ENST00000626257	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	33.92	■■■■□ 3.02
CCZ1B-215	ENST00000626257	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		33.92	■■■■□ 3.02
CCZ1B-215	ENST00000626257	RLBP1	P12271	317 aa		33.92	■■■■□ 3.02
CCZ1B-215	ENST00000626257	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	33.91	■■■■□ 3.02
CCZ1B-215	ENST00000626257	TNN	Q9UQP3	1299 aa		33.91	■■■■□ 3.02
CCZ1B-215	ENST00000626257	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		33.9	■■■■□ 3.02
CCZ1B-215	ENST00000626257	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		33.9	■■■■□ 3.02
CCZ1B-215	ENST00000626257	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		33.9	■■■■□ 3.02
CCZ1B-215	ENST00000626257	AAMP	Q13685	434 aa		33.89	■■■■□ 3.02
CCZ1B-215	ENST00000626257	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		33.89	■■■■□ 3.02
CCZ1B-215	ENST00000626257	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	33.88	■■■■□ 3.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	33.87	■■■■□ 3.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	33.85	■■■■□ 3.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	ATP7B	P35670	1465 aa		33.85	■■■■□ 3.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	33.83	■■■■□ 3.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		33.82	■■■■□ 3
CCZ1B-215	ENST00000626257	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		33.81	■■■■□ 3
CCZ1B-215	ENST00000626257	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	33.8	■■■■□ 3
CCZ1B-215	ENST00000626257	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		33.8	■■■■□ 3
CCZ1B-215	ENST00000626257	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	33.8	■■■■□ 3
CCZ1B-215	ENST00000626257	RIPK4	P57078	832 aa		33.79	■■■■□ 3
CCZ1B-215	ENST00000626257	IL16	Q14005	1332 aa		33.79	■■■■□ 3
CCZ1B-215	ENST00000626257	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	33.79	■■■■□ 3
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		33.79	■■■■□ 3
CCZ1B-215	ENST00000626257	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
CCZ1B-215	ENST00000626257	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	33.78	■■■■□ 3
CCZ1B-215	ENST00000626257	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
CCZ1B-215	ENST00000626257	MET	P08581	1390 aa		33.77	■■■■□ 3
CCZ1B-215	ENST00000626257	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.76	■■■■□ 3
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.76	■■■■□ 3
CCZ1B-215	ENST00000626257	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		33.76	■■■□□ 2.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	FBLN1	P23142	703 aa		33.75	■■■□□ 2.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	FCHSD2	O94868	740 aa		33.74	■■■□□ 2.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		33.74	■■■□□ 2.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.73	■■■□□ 2.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	33.73	■■■□□ 2.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		33.71	■■■□□ 2.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		33.71	■■■□□ 2.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		33.71	■■■□□ 2.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		33.71	■■■□□ 2.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	33.7	■■■□□ 2.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	33.7	■■■□□ 2.98
CCZ1B-215	ENST00000626257	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		33.69	■■■□□ 2.98
CCZ1B-215	ENST00000626257	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	33.68	■■■□□ 2.98
CCZ1B-215	ENST00000626257	PRKAR2B	P31323	418 aa		33.68	■■■□□ 2.98
CCZ1B-215	ENST00000626257	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		33.68	■■■□□ 2.98
CCZ1B-215	ENST00000626257	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
CCZ1B-215	ENST00000626257	TRIM27	P14373	513 aa		33.67	■■■□□ 2.98
CCZ1B-215	ENST00000626257	SLC4A3	P48751	1232 aa		33.66	■■■□□ 2.98
CCZ1B-215	ENST00000626257	NME9	Q86XW9	330 aa		33.65	■■■□□ 2.98
CCZ1B-215	ENST00000626257	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
CCZ1B-215	ENST00000626257	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		33.64	■■■□□ 2.98
CCZ1B-215	ENST00000626257	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
CCZ1B-215	ENST00000626257	SIRT1	Q96EB6	747 aa		33.63	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	33.63	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		33.63	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		33.63	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	TECPR2	O15040	1411 aa		33.63	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	NEFM	P07197	916 aa		33.63	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		33.63	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	TNR	Q92752	1358 aa		33.62	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.6	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		33.6	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	USP35	Q9P2H5	1018 aa		33.6	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		33.6	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	USP19	O94966	1318 aa		33.59	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	HMOX1	P09601	288 aa		33.59	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		33.58	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	CPS1	P31327	1500 aa		33.57	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	IL13	P35225	146 aa		33.57	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		33.57	■■■□□ 2.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		33.57	■■■□□ 2.96
CCZ1B-215	ENST00000626257	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
CCZ1B-215	ENST00000626257	SEC24B	O95487	1268 aa		33.57	■■■□□ 2.96
CCZ1B-215	ENST00000626257	NFE2L2	Q16236	605 aa		33.57	■■■□□ 2.96
CCZ1B-215	ENST00000626257	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		33.57	■■■□□ 2.96
CCZ1B-215	ENST00000626257	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		33.56	■■■□□ 2.96
CCZ1B-215	ENST00000626257	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		33.55	■■■□□ 2.96
CCZ1B-215	ENST00000626257	KIF16B	Q96L93	1317 aa		33.55	■■■□□ 2.96
CCZ1B-215	ENST00000626257	COG3	Q96JB2	828 aa		33.54	■■■□□ 2.96
CCZ1B-215	ENST00000626257	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		33.53	■■■□□ 2.96
CCZ1B-215	ENST00000626257	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		33.52	■■■□□ 2.96
CCZ1B-215	ENST00000626257	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
CCZ1B-215	ENST00000626257	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		33.52	■■■□□ 2.96
CCZ1B-215	ENST00000626257	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		33.5	■■■□□ 2.95
CCZ1B-215	ENST00000626257	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
CCZ1B-215	ENST00000626257	BCL11A	Q9H165	835 aa		33.49	■■■□□ 2.95
CCZ1B-215	ENST00000626257	AKAP12	Q02952	1782 aa		33.49	■■■□□ 2.95
CCZ1B-215	ENST00000626257	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		33.49	■■■□□ 2.95
CCZ1B-215	ENST00000626257	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
CCZ1B-215	ENST00000626257	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
CCZ1B-215	ENST00000626257	C3	P01024	1663 aa		33.48	■■■□□ 2.95
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms