RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-216	ENST00000619023	FANCA	O15360	1455 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	GNAI2	P04899	355 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	FCHSD2	O94868	740 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	ATP10B	O94823	1461 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	ATF3	P18847	181 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	NOS1	P29475	1434 aa		13.79	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		13.79	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	TRAK2	O60296	914 aa		13.79	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	RABEP1	Q15276	862 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	NFE2L2	Q16236	605 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	CLSTN1	O94985	981 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AKAP9-216	ENST00000619023	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	MRE11	P49959	708 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	BECN2	A8MW95	431 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	BICD2	Q8TD16	824 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	TRIM29	Q14134	588 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	MSH5	O43196	834 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	APP	P05067	770 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	FOSB	P53539	338 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	PSMA5	P28066	241 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023		G3V3G9	751 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	CPLX1	O14810	134 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	NEK4	P51957	841 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	NUP160	Q12769	1436 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	PLCH2	O75038	1416 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	NSD2	O96028	1365 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	MCM2	P49736	904 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	ABCC11	Q96J66	1382 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	TRDN	Q13061	729 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	HIP1	O00291	1037 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	SAMD9	Q5K651	1589 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-216	ENST00000619023	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
AKAP9-216	ENST00000619023	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-216	ENST00000619023	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-216	ENST00000619023	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-216	ENST00000619023	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-216	ENST00000619023	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-216	ENST00000619023	WASHC4	Q2M389	1173 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-216	ENST00000619023	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-216	ENST00000619023	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-216	ENST00000619023	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-216	ENST00000619023	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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