RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 MST1RQ04912 1400 aa41.9■■■■■ 4.3
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC21AQ8NDW8 1320 aa41.89■■■■■ 4.3
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa41.87■■■■■ 4.29
CAPNS1-206ENST00000588815 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP41.86■■■■■ 4.29
CAPNS1-206ENST00000588815 ESCO1Q5FWF5 840 aa41.85■■■■■ 4.29
CAPNS1-206ENST00000588815 GGNBP2Q9H3C7 697 aa41.85■■■■■ 4.29
CAPNS1-206ENST00000588815 USP54Q70EL1 1684 aa41.83■■■■■ 4.29
CAPNS1-206ENST00000588815 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
CAPNS1-206ENST00000588815 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
CAPNS1-206ENST00000588815 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.78■■■■■ 4.28
CAPNS1-206ENST00000588815 PIK3C2AO00443 1686 aa41.76■■■■■ 4.28
CAPNS1-206ENST00000588815 NME9Q86XW9 330 aa41.76■■■■■ 4.28
CAPNS1-206ENST00000588815 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
CAPNS1-206ENST00000588815 COG3Q96JB2 828 aa41.75■■■■■ 4.27
CAPNS1-206ENST00000588815 ORAI2Q96SN7 254 aa41.74■■■■■ 4.27
CAPNS1-206ENST00000588815 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa41.73■■■■■ 4.27
CAPNS1-206ENST00000588815 OVOS2Q6IE36 1432 aa41.73■■■■■ 4.27
CAPNS1-206ENST00000588815 USP31Q70CQ4 1352 aa41.72■■■■■ 4.27
CAPNS1-206ENST00000588815 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
CAPNS1-206ENST00000588815 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
CAPNS1-206ENST00000588815 PSME1Q06323 249 aa41.69■■■■■ 4.26
CAPNS1-206ENST00000588815 AATKQ6ZMQ8 1374 aa41.69■■■■■ 4.26
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM9BQ8IZU0 186 aa41.68■■■■■ 4.26
CAPNS1-206ENST00000588815 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
CAPNS1-206ENST00000588815 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
CAPNS1-206ENST00000588815 INSRP06213 1382 aa41.66■■■■■ 4.26
CAPNS1-206ENST00000588815 MTHFSP49914 203 aa41.62■■■■■ 4.25
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP53Q96M91 514 aa41.62■■■■■ 4.25
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXO3O43524 673 aa41.61■■■■■ 4.25
CAPNS1-206ENST00000588815 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
CAPNS1-206ENST00000588815 SLAIN2Q9P270 581 aa41.59■■■■■ 4.25
CAPNS1-206ENST00000588815 ZRANB1Q9UGI0 708 aa41.59■■■■■ 4.25
CAPNS1-206ENST00000588815 SHPRHQ149N8 1683 aa41.58■■■■■ 4.25
CAPNS1-206ENST00000588815 NPHP3Q7Z494 1330 aa41.58■■■■■ 4.25
CAPNS1-206ENST00000588815 ALS2Q96Q42 1657 aa41.56■■■■■ 4.24
CAPNS1-206ENST00000588815 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
CAPNS1-206ENST00000588815 ABTB2Q8N961 1025 aa41.55■■■■■ 4.24
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT28Q7Z3Y7 464 aa41.54■■■■■ 4.24
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP41.53■■■■■ 4.24
CAPNS1-206ENST00000588815 PNPLA6Q8IY17 1366 aa41.52■■■■■ 4.24
CAPNS1-206ENST00000588815 NLRP6P59044 892 aa41.52■■■■■ 4.24
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
CAPNS1-206ENST00000588815 SBNO1A3KN83 1393 aa41.5■■■■■ 4.23
CAPNS1-206ENST00000588815 BRINP3Q76B58 766 aa41.5■■■■■ 4.23
CAPNS1-206ENST00000588815 POLKQ9UBT6 870 aa41.5■■■■■ 4.23
CAPNS1-206ENST00000588815 NHSL1Q5SYE7 1610 aa41.49■■■■■ 4.23
CAPNS1-206ENST00000588815 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
CAPNS1-206ENST00000588815 PXDNQ92626 1479 aa41.48■■■■■ 4.23
CAPNS1-206ENST00000588815 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
CAPNS1-206ENST00000588815 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP41.42■■■■■ 4.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SLIT3O75094 1523 aa41.4■■■■■ 4.22
CAPNS1-206ENST00000588815 LTN1O94822 1766 aa41.4■■■■■ 4.22
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF24Q5T7B8 1368 aa41.4■■■■■ 4.22
CAPNS1-206ENST00000588815 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAMTS8Q9UP79 889 aa41.39■■■■■ 4.22
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDCQ9Y266 331 aa41.39■■■■■ 4.22
CAPNS1-206ENST00000588815 TNS3Q68CZ2 1445 aa41.38■■■■■ 4.21
CAPNS1-206ENST00000588815 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.37■■■■■ 4.21
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNH5Q8NCM2 988 aa41.37■■■■■ 4.21
CAPNS1-206ENST00000588815 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa41.37■■■■■ 4.21
CAPNS1-206ENST00000588815 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
CAPNS1-206ENST00000588815 PEAK1Q9H792 1746 aa41.36■■■■■ 4.21
CAPNS1-206ENST00000588815 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa41.35■■■■■ 4.21
CAPNS1-206ENST00000588815 FBLN1P23142 703 aa41.35■■■■■ 4.21
CAPNS1-206ENST00000588815 NFAT5O94916 1531 aa41.35■■■■■ 4.21
CAPNS1-206ENST00000588815 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
CAPNS1-206ENST00000588815 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
CAPNS1-206ENST00000588815 USP19O94966 1318 aa41.33■■■■■ 4.21
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGEF10O15013 1369 aa41.33■■■■■ 4.21
CAPNS1-206ENST00000588815 NUTM2GQ5VZR2 741 aa41.33■■■■■ 4.21
CAPNS1-206ENST00000588815 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.2
CAPNS1-206ENST00000588815 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa41.31■■■■■ 4.2
CAPNS1-206ENST00000588815 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa41.3■■■■■ 4.2
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBED9Q6R2W3 1325 aa41.3■■■■■ 4.2
CAPNS1-206ENST00000588815 FLT4P35916 1363 aa41.29■■■■■ 4.2
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP3K19Q56UN5 1328 aa41.28■■■■■ 4.2
CAPNS1-206ENST00000588815 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
CAPNS1-206ENST00000588815 RTL1A6NKG5 1358 aa41.26■■■■■ 4.2
CAPNS1-206ENST00000588815 LMOD2Q6P5Q4 547 aa41.26■■■■■ 4.2
CAPNS1-206ENST00000588815 SOX12O15370 315 aa41.22■■■■■ 4.19
CAPNS1-206ENST00000588815 TOM1O60784 492 aa41.21■■■■■ 4.19
CAPNS1-206ENST00000588815 GCP02774 474 aa41.2■■■■■ 4.19
CAPNS1-206ENST00000588815 AMPHP49418 695 aa41.2■■■■■ 4.19
CAPNS1-206ENST00000588815 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
CAPNS1-206ENST00000588815 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP41.19■■■■■ 4.18
CAPNS1-206ENST00000588815 IL13P35225 146 aa41.18■■■■■ 4.18
CAPNS1-206ENST00000588815 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
CAPNS1-206ENST00000588815 RGPD1P0DJD0 1748 aa41.17■■■■■ 4.18
CAPNS1-206ENST00000588815 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
CAPNS1-206ENST00000588815 NGEFQ8N5V2 710 aa41.16■■■■■ 4.18
CAPNS1-206ENST00000588815 RUNDC1Q96C34 613 aa41.14■■■■■ 4.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCA3Q99758 1704 aa41.13■■■■■ 4.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXC9P31274 260 aa41.12■■■■■ 4.17
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCC6O95255 1503 aa41.11■■■■■ 4.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa41.11■■■■■ 4.17
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