RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SIRT1Q96EB6 747 aa21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AKAP12Q02952 1782 aa21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ITSN1Q15811 1721 aa21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AAMPQ13685 434 aa21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SKAP1Q86WV1 359 aa21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IL16Q14005 1332 aa21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C3P01024 1663 aa21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PANK1Q8TE04 598 aa21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POLKQ9UBT6 870 aa21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COG6Q9Y2V7 657 aa21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FCHSD2O94868 740 aa21.27■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.27■■□□□ 1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.26■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.26■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.26■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGHDP01880 384 aa21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RIPK4P57078 832 aa21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM161AQ3B820 660 aa21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RLBP1P12271 317 aa21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NME9Q86XW9 330 aa21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLIT1O75093 1534 aa21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C8orf34Q49A92 452 aa21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FBLN1P23142 703 aa21.19■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.19■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LTKP29376 864 aa21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRKAR2BP31323 418 aa21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TNNQ9UQP3 1299 aa21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NEFMP07197 916 aa21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IL13P35225 146 aa21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COG3Q96JB2 828 aa21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RGS3P49796 1198 aa21.16■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.16■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NFE2L2Q16236 605 aa21.14■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTPRUQ92729 1446 aa21.14■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.14■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DIP2AQ14689 1571 aa21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EID1Q9Y6B2 187 aa21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HMOX1P09601 288 aa21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF428Q96B54 188 aa21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.1■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTCH1Q13635 1447 aa21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms