RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542322.5

GRAMD2B-218, Transcript of GRAM domain containing 2B, humanhuman

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Gene GRAMD2B, Length 2,977 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2B-218ENST00000542322 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.01■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 ABCC11Q96J66 1382 aa23■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 PLEKHG5O94827 1062 aa23■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 SSH1Q8WYL5 1049 aa23■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 SEC24BO95487 1268 aa22.99■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 PTPRMP28827 1452 aa22.99■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.99■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.98■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.98■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.98■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.97■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.96■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 POLKQ9UBT6 870 aa22.96■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 NGEFQ8N5V2 710 aa22.96■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.96■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.95■■□□□ 1.27
GRAMD2B-218ENST00000542322 METP08581 1390 aa22.95■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 DCTN1Q14203 1278 aa22.95■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.95■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 ALKQ9UM73 1620 aa22.94■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.93■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.93■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.93■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 TRIM27P14373 513 aa22.93■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 FAM83GA6ND36 823 aa22.92■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 NSD2O96028 1365 aa22.92■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.92■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.92■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.91■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.91■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.9■■□□□ 1.26
GRAMD2B-218ENST00000542322 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.89■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZMYM3Q14202 1370 aa22.89■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.89■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 CCDC27Q2M243 656 aa22.88■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 COG3Q96JB2 828 aa22.88■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.88■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.88■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 TSPYL6Q8N831 410 aa22.86■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 DIP2BQ9P265 1576 aa22.86■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZFYVE9O95405 1425 aa22.86■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.84■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.84■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.84■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.84■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
GRAMD2B-218ENST00000542322 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.82■■□□□ 1.24
GRAMD2B-218ENST00000542322 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.82■■□□□ 1.24
GRAMD2B-218ENST00000542322 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.81■■□□□ 1.24
GRAMD2B-218ENST00000542322 FCHSD2O94868 740 aa22.8■■□□□ 1.24
GRAMD2B-218ENST00000542322 LTKP29376 864 aa22.8■■□□□ 1.24
GRAMD2B-218ENST00000542322 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
GRAMD2B-218ENST00000542322 KRT24Q2M2I5 525 aa22.8■■□□□ 1.24
GRAMD2B-218ENST00000542322 LNPKQ9C0E8 428 aa22.8■■□□□ 1.24
GRAMD2B-218ENST00000542322 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.79■■□□□ 1.24
GRAMD2B-218ENST00000542322 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.79■■□□□ 1.24
GRAMD2B-218ENST00000542322 C14orf37Q86TY3 774 aa22.78■■□□□ 1.24
GRAMD2B-218ENST00000542322 NLRP1Q9C000 1473 aa22.78■■□□□ 1.24
GRAMD2B-218ENST00000542322 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
GRAMD2B-218ENST00000542322 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
GRAMD2B-218ENST00000542322 NFE2L2Q16236 605 aa22.77■■□□□ 1.24
GRAMD2B-218ENST00000542322 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.77■■□□□ 1.24
GRAMD2B-218ENST00000542322 NFKBIBQ15653 356 aa22.77■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.76■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 MCM10Q7L590 875 aa22.76■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.76■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 APBB1O00213 710 aa22.75■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 MBIPQ9NS73 344 aa22.75■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 USP32Q8NFA0 1604 aa22.75■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.75■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 TNRQ92752 1358 aa22.75■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 IL13P35225 146 aa22.74■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.74■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 ACEP12821 1306 aa22.74■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.74■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.74■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 ARXQ96QS3 562 aa22.73■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 USP19O94966 1318 aa22.71■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
GRAMD2B-218ENST00000542322 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
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