RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 ORAI2Q96SN7 254 aa9.29□□□□□ -0.92
ROBO1-211ENST00000498428 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ROBO1-211ENST00000498428 PDE4AP27815 886 aa9.29□□□□□ -0.92
ROBO1-211ENST00000498428 KIF1BO60333 1816 aa9.29□□□□□ -0.92
ROBO1-211ENST00000498428 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.29□□□□□ -0.92
ROBO1-211ENST00000498428 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ROBO1-211ENST00000498428 VWDEQ8N2E2 1590 aa9.28□□□□□ -0.92
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ROBO1-211ENST00000498428 DEPDC5O75140 1603 aa9.28□□□□□ -0.92
ROBO1-211ENST00000498428 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
ROBO1-211ENST00000498428 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.28□□□□□ -0.92
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ROBO1-211ENST00000498428 PIK3C2GO75747 1445 aa9.28□□□□□ -0.92
ROBO1-211ENST00000498428 CGNL1Q0VF96 1302 aa9.28□□□□□ -0.92
ROBO1-211ENST00000498428 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.27□□□□□ -0.92
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ROBO1-211ENST00000498428 ACEP12821 1306 aa9.26□□□□□ -0.93
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ROBO1-211ENST00000498428 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
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ROBO1-211ENST00000498428 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
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ROBO1-211ENST00000498428 ABCC11Q96J66 1382 aa9.23□□□□□ -0.93
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ROBO1-211ENST00000498428 MYOM2P54296 1465 aa9.22□□□□□ -0.93
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ROBO1-211ENST00000498428 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
ROBO1-211ENST00000498428 NLRP13Q86W25 1043 aa9.22□□□□□ -0.93
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ROBO1-211ENST00000498428 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.21□□□□□ -0.94
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ROBO1-211ENST00000498428 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.2□□□□□ -0.94
ROBO1-211ENST00000498428 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
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ROBO1-211ENST00000498428 CHRNA2Q15822 529 aa9.19□□□□□ -0.94
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ROBO1-211ENST00000498428 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
ROBO1-211ENST00000498428 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.19□□□□□ -0.94
ROBO1-211ENST00000498428 A0A1W2PP64 1363 aa9.19□□□□□ -0.94
ROBO1-211ENST00000498428 VGLL3A8MV65 326 aa9.19□□□□□ -0.94
ROBO1-211ENST00000498428 FYB1O15117 783 aa9.19□□□□□ -0.94
ROBO1-211ENST00000498428 PTPRUQ92729 1446 aa9.19□□□□□ -0.94
ROBO1-211ENST00000498428 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9.18□□□□□ -0.94
ROBO1-211ENST00000498428 RNF123Q5XPI4 1314 aa9.18□□□□□ -0.94
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