RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 SOX11P35716 441 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNC4Q03721 635 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-205ENST00000462042 PRDM9Q9NQV7 894 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP10Q9P2G4 905 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-205ENST00000462042 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-205ENST00000462042 NBPF14Q5TI25 921 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC82Q8N4S0 544 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-205ENST00000462042 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
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RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF592Q92610 1267 aa10.69□□□□□ -0.7
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RABGGTB-205ENST00000462042 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.7
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RABGGTB-205ENST00000462042 VAC14Q08AM6 782 aa10.67□□□□□ -0.7
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RABGGTB-205ENST00000462042 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-205ENST00000462042 UNC93B1Q9H1C4 597 aa10.65□□□□□ -0.7
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RABGGTB-205ENST00000462042 SEMA3FQ13275 785 aa10.63□□□□□ -0.71
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RABGGTB-205ENST00000462042 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF223E7ERA6 249 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 IFFO2Q5TF58 517 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB33Q86T24 672 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF511Q8NB15 262 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 BAP1Q92560 729 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 ADAM32Q8TC27 787 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 RPIAP49247 311 aa10.53□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 AGERQ15109 404 aa10.53□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP1R18Q6NYC8 613 aa10.53□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.53□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa10.53□□□□□ -0.72
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa10.53□□□□□ -0.72
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RABGGTB-205ENST00000462042 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
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RABGGTB-205ENST00000462042 UCN2Q96RP3 112 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGGTB-205ENST00000462042 CEP126Q9P2H0 1117 aa10.49□□□□□ -0.73
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RABGGTB-205ENST00000462042 SH3BP2P78314 561 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGGTB-205ENST00000462042 SLFNL1Q499Z3 407 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGGTB-205ENST00000462042 FOXJ1Q92949 421 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGGTB-205ENST00000462042 CARD14Q9BXL6 1004 aa10.48□□□□□ -0.73
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RABGGTB-205ENST00000462042 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
RABGGTB-205ENST00000462042 ERFEQ4G0M1 354 aa10.47□□□□□ -0.73
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RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC125Q86Z20 511 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGGTB-205ENST00000462042 PBXIP1Q96AQ6 731 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC10A4Q96EP9 437 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGGTB-205ENST00000462042 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa10.47□□□□□ -0.73
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RABGGTB-205ENST00000462042 PLA2G2CQ5R387 149 aa10.46□□□□□ -0.73
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RABGGTB-205ENST00000462042 RNF20Q5VTR2 975 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM174AQ8TBP5 190 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 PDE4CQ08493 712 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF135Q8IUD6 432 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 SKIP12755 728 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 RFX1P22670 979 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP7D1Q3KQU3 841 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 SEPT12Q8IYM1 358 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 PHTF2Q8N3S3 785 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 EHBP1Q8NDI1 1231 aa10.41□□□□□ -0.74
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