RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445369.2

CLDN9-201, Transcript of claudin 9, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN9, Length 2,050 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9-201ENST00000445369 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CLDN9-201ENST00000445369 COG6Q9Y2V7 657 aa23.02■■□□□ 1.28
CLDN9-201ENST00000445369 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CLDN9-201ENST00000445369 ZMYM3Q14202 1370 aa23.01■■□□□ 1.27
CLDN9-201ENST00000445369 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
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CLDN9-201ENST00000445369 IGHDP01880 384 aa23■■□□□ 1.27
CLDN9-201ENST00000445369 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
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CLDN9-201ENST00000445369 AAMPQ13685 434 aa22.99■■□□□ 1.27
CLDN9-201ENST00000445369 C8orf34Q49A92 452 aa22.99■■□□□ 1.27
CLDN9-201ENST00000445369 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.99■■□□□ 1.27
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CLDN9-201ENST00000445369 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.98■■□□□ 1.27
CLDN9-201ENST00000445369 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CLDN9-201ENST00000445369 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CLDN9-201ENST00000445369 TECPR2O15040 1411 aa22.98■■□□□ 1.27
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CLDN9-201ENST00000445369 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.97■■□□□ 1.27
CLDN9-201ENST00000445369 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.97■■□□□ 1.27
CLDN9-201ENST00000445369 RLBP1P12271 317 aa22.96■■□□□ 1.27
CLDN9-201ENST00000445369 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.96■■□□□ 1.27
CLDN9-201ENST00000445369 RGS3P49796 1198 aa22.96■■□□□ 1.27
CLDN9-201ENST00000445369 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.96■■□□□ 1.27
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CLDN9-201ENST00000445369 IL16Q14005 1332 aa22.95■■□□□ 1.26
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CLDN9-201ENST00000445369 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.94■■□□□ 1.26
CLDN9-201ENST00000445369 AKAP12Q02952 1782 aa22.94■■□□□ 1.26
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CLDN9-201ENST00000445369 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
CLDN9-201ENST00000445369 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CLDN9-201ENST00000445369 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CLDN9-201ENST00000445369 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.92■■□□□ 1.26
CLDN9-201ENST00000445369 POLKQ9UBT6 870 aa22.92■■□□□ 1.26
CLDN9-201ENST00000445369 ITSN1Q15811 1721 aa22.92■■□□□ 1.26
CLDN9-201ENST00000445369 SIRT1Q96EB6 747 aa22.91■■□□□ 1.26
CLDN9-201ENST00000445369 NBR1Q14596 966 aa22.9■■□□□ 1.26
CLDN9-201ENST00000445369 C3P01024 1663 aa22.9■■□□□ 1.26
CLDN9-201ENST00000445369 FCHSD2O94868 740 aa22.89■■□□□ 1.26
CLDN9-201ENST00000445369 RIPK4P57078 832 aa22.89■■□□□ 1.26
CLDN9-201ENST00000445369 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CLDN9-201ENST00000445369 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.89■■□□□ 1.26
CLDN9-201ENST00000445369 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.89■■□□□ 1.25
CLDN9-201ENST00000445369 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
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CLDN9-201ENST00000445369 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.88■■□□□ 1.25
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CLDN9-201ENST00000445369 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.84■■□□□ 1.25
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CLDN9-201ENST00000445369 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.83■■□□□ 1.25
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CLDN9-201ENST00000445369 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.83■■□□□ 1.24
CLDN9-201ENST00000445369 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.82■■□□□ 1.24
CLDN9-201ENST00000445369 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.82■■□□□ 1.24
CLDN9-201ENST00000445369 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CLDN9-201ENST00000445369 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
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CLDN9-201ENST00000445369 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.81■■□□□ 1.24
CLDN9-201ENST00000445369 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.8■■□□□ 1.24
CLDN9-201ENST00000445369 IL13P35225 146 aa22.8■■□□□ 1.24
CLDN9-201ENST00000445369 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.79■■□□□ 1.24
CLDN9-201ENST00000445369 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.79■■□□□ 1.24
CLDN9-201ENST00000445369 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.79■■□□□ 1.24
CLDN9-201ENST00000445369 NEFMP07197 916 aa22.78■■□□□ 1.24
CLDN9-201ENST00000445369 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.78■■□□□ 1.24
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CLDN9-201ENST00000445369 NFE2L2Q16236 605 aa22.78■■□□□ 1.24
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CLDN9-201ENST00000445369 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.77■■□□□ 1.23
CLDN9-201ENST00000445369 HMOX1P09601 288 aa22.76■■□□□ 1.23
CLDN9-201ENST00000445369 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.76■■□□□ 1.23
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CLDN9-201ENST00000445369 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.75■■□□□ 1.23
CLDN9-201ENST00000445369 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CLDN9-201ENST00000445369 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CLDN9-201ENST00000445369 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CLDN9-201ENST00000445369 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.75■■□□□ 1.23
CLDN9-201ENST00000445369 USP19O94966 1318 aa22.73■■□□□ 1.23
CLDN9-201ENST00000445369 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.73■■□□□ 1.23
CLDN9-201ENST00000445369 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF428Q96B54 188 aa22.72■■□□□ 1.23
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