RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420095.1

LMCD1-AS1-201, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 2,144 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MON2Q7Z3U7 1717 aa15.79■□□□□ 0.12
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 AKAP12Q02952 1782 aa15.79■□□□□ 0.12
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa15.78■□□□□ 0.12
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PLEKHG3A1L390 1219 aa15.78■□□□□ 0.12
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DEKP35659 375 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.77■□□□□ 0.12
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CCDC146Q8IYE0 955 aa15.77■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ITSN1Q15811 1721 aa15.76■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.76■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 APAF1O14727 1248 aa15.76■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PNPLA6Q8IY17 1366 aa15.75■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RUNDC1Q96C34 613 aa15.75■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 GOLGA2Q08379 1002 aa15.73■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RCAN3Q9UKA8 241 aa15.73■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KCNA6P17658 529 aa15.73■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.72■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.72■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SLFN5Q08AF3 891 aa15.71■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NME9Q86XW9 330 aa15.71■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 AATKQ6ZMQ8 1374 aa15.71■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ACEP12821 1306 aa15.71■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.71■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NRKQ7Z2Y5 1582 aa15.71■□□□□ 0.11
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.7■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 POLKQ9UBT6 870 aa15.7■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PODXL2Q9NZ53 605 aa15.7■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa15.69■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 USP6P35125 1406 aa15.69■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SSH2Q76I76 1423 aa15.69■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 COG3Q96JB2 828 aa15.68■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CCDC27Q2M243 656 aa15.68■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TCP11L2Q8N4U5 519 aa15.68■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.68■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 FMN2Q9NZ56 1722 aa15.67■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 E9PSI1 815 aa15.67■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 WWC1Q8IX03 1113 aa15.66■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PLEKHF1Q96S99 279 aa15.66■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NUTM2FA1L443 756 aa15.65■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TTC21AQ8NDW8 1320 aa15.65■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 WDR63Q8IWG1 891 aa15.64■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa15.64■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 OVOS2Q6IE36 1432 aa15.64■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 FBLN1P23142 703 aa15.63■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NWD1Q149M9 1564 aa15.63■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DMRT2Q9Y5R5 561 aa15.62■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 USP31Q70CQ4 1352 aa15.62■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NALCNQ8IZF0 1738 aa15.62■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa15.62■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 FCHSD2O94868 740 aa15.61■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.61■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa15.61■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 IL13P35225 146 aa15.61■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.61■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TMPOP42166 694 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NEUROD2Q15784 382 aa15.58■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.58■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.58■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 LRRC7Q96NW7 1537 aa15.56■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 USP54Q70EL1 1684 aa15.56■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.56■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.55■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.55■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PIK3C2AO00443 1686 aa15.55■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 IL16Q14005 1332 aa15.54■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 EXOC6Q8TAG9 804 aa15.54■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PLIN1O60240 522 aa15.53■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PRKAR2BP31323 418 aa15.53■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.53■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PEAK1Q9H792 1746 aa15.53■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RIPK4P57078 832 aa15.52■□□□□ 0.08
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NEFMP07197 916 aa15.51■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NFE2L2Q16236 605 aa15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms