RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416195.1

SP3-202, Transcript of Sp3 transcription factor, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SP3, Length 3,627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3-202ENST00000416195 WASLO00401 505 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 SHROOM2Q13796 1616 aa14.76□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 C8orf34Q49A92 452 aa14.76□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.76□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 FOXO3O43524 673 aa14.75□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 PDE3AQ14432 1141 aa14.75□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.75□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 ATAD2Q6PL18 1390 aa14.75□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa14.75□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 WDR63Q8IWG1 891 aa14.75□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.75□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.75□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 PIK3C2GO75747 1445 aa14.75□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 MADDQ8WXG6 1647 aa14.75□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 NFKBIBQ15653 356 aa14.74□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 A0A0G2JS52 829 aa14.74□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 CEP152O94986 1710 aa14.73□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 BECN1Q14457 450 aa14.73□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 ZMYND15Q9H091 742 aa14.72□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 F6X3S4 739 aa14.72□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.72□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 PDE4CQ08493 712 aa14.71□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa14.71□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.71□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.71□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.71□□□□□ -0.05
SP3-202ENST00000416195 ACEP12821 1306 aa14.7□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 LTKP29376 864 aa14.7□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 ABTB2Q8N961 1025 aa14.7□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 METP08581 1390 aa14.7□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 ABCA6Q8N139 1617 aa14.7□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 MBIPQ9NS73 344 aa14.7□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.69□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 NFE2L2Q16236 605 aa14.68□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.68□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 NGEFQ8N5V2 710 aa14.68□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.68□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 TET3O43151 1660 aa14.67□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.67□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 FCHSD2O94868 740 aa14.67□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.67□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 ZMYM3Q14202 1370 aa14.67□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.67□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 SLC4A2P04920 1241 aa14.66□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.66□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 ABCC3O15438 1527 aa14.66□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.66□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 GNAI1P63096 354 aa14.66□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 ANXA1P04083 346 aa14.65□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.65□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 KIF1BO60333 1816 aa14.65□□□□□ -0.06
SP3-202ENST00000416195 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.64□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.64□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.63□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.63□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 PSME1Q06323 249 aa14.63□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 KIF16BQ96L93 1317 aa14.63□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.62□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.62□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 INSRP06213 1382 aa14.62□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 SYNMO15061 1565 aa14.62□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 HSCBQ8IWL3 235 aa14.62□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.61□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 PRR36Q9H6K5 1346 aa14.61□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 MROH2AA6NES4 1674 aa14.61□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.6□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 KCNA6P17658 529 aa14.6□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 STK31Q9BXU1 1019 aa14.6□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.6□□□□□ -0.07
SP3-202ENST00000416195 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms