RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367760.7

PRRX1-202, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 2,217 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-202ENST00000367760 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.93■■□□□ 1.1
PRRX1-202ENST00000367760 TECPR2O15040 1411 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRX1-202ENST00000367760 TNRQ92752 1358 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRX1-202ENST00000367760 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRX1-202ENST00000367760 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRX1-202ENST00000367760 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PRRX1-202ENST00000367760 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRX1-202ENST00000367760 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PRRX1-202ENST00000367760 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PRRX1-202ENST00000367760 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRX1-202ENST00000367760 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PRRX1-202ENST00000367760 IL16Q14005 1332 aa21.89■■□□□ 1.09
PRRX1-202ENST00000367760 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PRRX1-202ENST00000367760 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PRRX1-202ENST00000367760 CPS1P31327 1500 aa21.88■■□□□ 1.09
PRRX1-202ENST00000367760 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PRRX1-202ENST00000367760 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRX1-202ENST00000367760 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PRRX1-202ENST00000367760 METP08581 1390 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRX1-202ENST00000367760 NBR1Q14596 966 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRX1-202ENST00000367760 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.85■■□□□ 1.09
PRRX1-202ENST00000367760 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.85■■□□□ 1.09
PRRX1-202ENST00000367760 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.85■■□□□ 1.09
PRRX1-202ENST00000367760 FCHSD2O94868 740 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRX1-202ENST00000367760 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PRRX1-202ENST00000367760 PANK1Q8TE04 598 aa21.83■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 FAM161AQ3B820 660 aa21.82■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 COG6Q9Y2V7 657 aa21.82■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.82■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.81■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 NEFMP07197 916 aa21.8■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.8■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.8■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.8■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 POLKQ9UBT6 870 aa21.8■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.8■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.8■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 SKAP1Q86WV1 359 aa21.79■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 RIPK4P57078 832 aa21.78■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.77■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.77■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.77■■□□□ 1.08
PRRX1-202ENST00000367760 IGHDP01880 384 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 AKAP12Q02952 1782 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 ITSN1Q15811 1721 aa21.75■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.75■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.75■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 C8orf34Q49A92 452 aa21.74■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 COG3Q96JB2 828 aa21.74■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 RLBP1P12271 317 aa21.73■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 RGS3P49796 1198 aa21.73■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.73■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.72■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 C3P01024 1663 aa21.72■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 ZNF428Q96B54 188 aa21.72■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 PRKAR2BP31323 418 aa21.71■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 NME9Q86XW9 330 aa21.71■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.71■■□□□ 1.07
PRRX1-202ENST00000367760 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 NFE2L2Q16236 605 aa21.7■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 IL13P35225 146 aa21.69■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 KIF16BQ96L93 1317 aa21.69■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.68■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.67■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 EID1Q9Y6B2 187 aa21.67■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.67■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.67■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.67■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.67■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 SLIT1O75093 1534 aa21.66■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.66■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 TNNQ9UQP3 1299 aa21.66■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.66■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.65■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.65■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.64■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.64■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
PRRX1-202ENST00000367760 TRIM27P14373 513 aa21.64■■□□□ 1.05
PRRX1-202ENST00000367760 LTKP29376 864 aa21.64■■□□□ 1.05
PRRX1-202ENST00000367760 FBLN1P23142 703 aa21.63■■□□□ 1.05
PRRX1-202ENST00000367760 IFT57Q9NWB7 429 aa21.62■■□□□ 1.05
PRRX1-202ENST00000367760 DIP2AQ14689 1571 aa21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms