RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.39■■□□□ 1.5
SNX11-201ENST00000359238 USP35Q9P2H5 1018 aa24.39■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.39■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 ATP7BP35670 1465 aa24.38■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.38■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 PIK3R4Q99570 1358 aa24.37■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 ADGRB2O60241 1585 aa24.37■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.37■■□□□ 1.49
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SNX11-201ENST00000359238 NSD2O96028 1365 aa24.36■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 APAF1O14727 1248 aa24.35■■□□□ 1.49
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SNX11-201ENST00000359238 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.32■■□□□ 1.48
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SNX11-201ENST00000359238 ZNF521Q96K83 1311 aa24.32■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 NME9Q86XW9 330 aa24.32■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.31■■□□□ 1.48
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SNX11-201ENST00000359238 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.28■■□□□ 1.48
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SNX11-201ENST00000359238 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.24■■□□□ 1.47
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SNX11-201ENST00000359238 NEUROD2Q15784 382 aa24.23■■□□□ 1.47
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SNX11-201ENST00000359238 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.22■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.22■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.21■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 POLKQ9UBT6 870 aa24.21■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.2■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.2■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
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SNX11-201ENST00000359238 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.18■■□□□ 1.46
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SNX11-201ENST00000359238 C14orf37Q86TY3 774 aa24.17■■□□□ 1.46
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SNX11-201ENST00000359238 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.15■■□□□ 1.46
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SNX11-201ENST00000359238 MS4A1P11836 297 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 PDE4AP27815 886 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 WWC1Q8IX03 1113 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.14■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.14■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.14■■□□□ 1.46
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SNX11-201ENST00000359238 NWD1Q149M9 1564 aa24.13■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.13■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
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SNX11-201ENST00000359238 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.12■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 SSH2Q76I76 1423 aa24.09■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 SOX12O15370 315 aa24.07■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.06■■□□□ 1.44
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SNX11-201ENST00000359238 HMOX1P09601 288 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 GSE1Q14687 1217 aa24.04■■□□□ 1.44
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SNX11-201ENST00000359238 PEAK1Q9H792 1746 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 PIK3C2AO00443 1686 aa24.02■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 TMEM94Q12767 1356 aa24.02■■□□□ 1.44
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