RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
GIPC1-201ENST00000345425 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.69
GIPC1-201ENST00000345425 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa38.07■■■■□ 3.69
GIPC1-201ENST00000345425 TTC21AQ8NDW8 1320 aa38.07■■■■□ 3.69
GIPC1-201ENST00000345425 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.68
GIPC1-201ENST00000345425 CGNL1Q0VF96 1302 aa38.06■■■■□ 3.68
GIPC1-201ENST00000345425 SBNO1A3KN83 1393 aa38.05■■■■□ 3.68
GIPC1-201ENST00000345425 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
GIPC1-201ENST00000345425 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP38.05■■■■□ 3.68
GIPC1-201ENST00000345425 PHLPP1O60346 1717 aa38.02■■■■□ 3.68
GIPC1-201ENST00000345425 KIF20BQ96Q89 1820 aa37.99■■■■□ 3.67
GIPC1-201ENST00000345425 TNS3Q68CZ2 1445 aa37.98■■■■□ 3.67
GIPC1-201ENST00000345425 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP37.97■■■■□ 3.67
GIPC1-201ENST00000345425 NSD2O96028 1365 aa37.97■■■■□ 3.67
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa37.96■■■■□ 3.67
GIPC1-201ENST00000345425 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa37.96■■■■□ 3.67
GIPC1-201ENST00000345425 ALS2Q96Q42 1657 aa37.96■■■■□ 3.67
GIPC1-201ENST00000345425 ABTB2Q8N961 1025 aa37.96■■■■□ 3.67
GIPC1-201ENST00000345425 FYB1O15117 783 aa37.95■■■■□ 3.67
GIPC1-201ENST00000345425 PIK3C2AO00443 1686 aa37.95■■■■□ 3.67
GIPC1-201ENST00000345425 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
GIPC1-201ENST00000345425 NME9Q86XW9 330 aa37.94■■■■□ 3.66
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGEF10O15013 1369 aa37.93■■■■□ 3.66
GIPC1-201ENST00000345425 LMOD2Q6P5Q4 547 aa37.92■■■■□ 3.66
GIPC1-201ENST00000345425 GGNBP2Q9H3C7 697 aa37.9■■■■□ 3.66
GIPC1-201ENST00000345425 USP31Q70CQ4 1352 aa37.89■■■■□ 3.66
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa37.88■■■■□ 3.65
GIPC1-201ENST00000345425 NLRP6P59044 892 aa37.88■■■■□ 3.65
GIPC1-201ENST00000345425 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
GIPC1-201ENST00000345425 COG3Q96JB2 828 aa37.87■■■■□ 3.65
GIPC1-201ENST00000345425 USP54Q70EL1 1684 aa37.86■■■■□ 3.65
GIPC1-201ENST00000345425 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
GIPC1-201ENST00000345425 NLRP13Q86W25 1043 aa37.86■■■■□ 3.65
GIPC1-201ENST00000345425 FBXO41Q8TF61 875 aa37.85■■■■□ 3.65
GIPC1-201ENST00000345425 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa37.85■■■■□ 3.65
GIPC1-201ENST00000345425 OVOS2Q6IE36 1432 aa37.85■■■■□ 3.65
GIPC1-201ENST00000345425 NUTM2GQ5VZR2 741 aa37.84■■■■□ 3.65
GIPC1-201ENST00000345425 ZRANB1Q9UGI0 708 aa37.83■■■■□ 3.65
GIPC1-201ENST00000345425 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
GIPC1-201ENST00000345425 HSPA1LP34931 641 aa37.8■■■■□ 3.64
GIPC1-201ENST00000345425 MORC1Q86VD1 984 aa37.8■■■■□ 3.64
GIPC1-201ENST00000345425 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
GIPC1-201ENST00000345425 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP37.79■■■■□ 3.64
GIPC1-201ENST00000345425 PNPLA6Q8IY17 1366 aa37.77■■■■□ 3.64
GIPC1-201ENST00000345425 ANP32CO43423 234 aa37.76■■■■□ 3.64
GIPC1-201ENST00000345425 USP19O94966 1318 aa37.76■■■■□ 3.64
GIPC1-201ENST00000345425 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
GIPC1-201ENST00000345425 RALBP1Q15311 655 aa37.73■■■■□ 3.63
GIPC1-201ENST00000345425 PARD3Q8TEW0 1356 aa37.73■■■■□ 3.63
GIPC1-201ENST00000345425 JCADQ9P266 1359 aa37.73■■■■□ 3.63
GIPC1-201ENST00000345425 SHPRHQ149N8 1683 aa37.73■■■■□ 3.63
GIPC1-201ENST00000345425 SLIT3O75094 1523 aa37.73■■■■□ 3.63
GIPC1-201ENST00000345425 KCNH5Q8NCM2 988 aa37.72■■■■□ 3.63
GIPC1-201ENST00000345425 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
GIPC1-201ENST00000345425 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa37.71■■■■□ 3.63
GIPC1-201ENST00000345425 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
GIPC1-201ENST00000345425 PLEKHG5O94827 1062 aa37.68■■■■□ 3.62
GIPC1-201ENST00000345425 GCP02774 474 aa37.67■■■■□ 3.62
GIPC1-201ENST00000345425 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
GIPC1-201ENST00000345425 CABLES1Q8TDN4 633 aa37.66■■■■□ 3.62
GIPC1-201ENST00000345425 ABCA3Q99758 1704 aa37.66■■■■□ 3.62
GIPC1-201ENST00000345425 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
GIPC1-201ENST00000345425 AATKQ6ZMQ8 1374 aa37.65■■■■□ 3.62
GIPC1-201ENST00000345425 SOX12O15370 315 aa37.64■■■■□ 3.62
GIPC1-201ENST00000345425 NFAT5O94916 1531 aa37.62■■■■□ 3.61
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa37.58■■■■□ 3.61
GIPC1-201ENST00000345425 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
GIPC1-201ENST00000345425 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.61
GIPC1-201ENST00000345425 PPP2R1AP30153 589 aa37.56■■■■□ 3.6
GIPC1-201ENST00000345425 FBLN1P23142 703 aa37.55■■■■□ 3.6
GIPC1-201ENST00000345425 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
GIPC1-201ENST00000345425 LTN1O94822 1766 aa37.53■■■■□ 3.6
GIPC1-201ENST00000345425 CPDO75976 1380 aa37.53■■■■□ 3.6
GIPC1-201ENST00000345425 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
GIPC1-201ENST00000345425 POLKQ9UBT6 870 aa37.52■■■■□ 3.6
GIPC1-201ENST00000345425 MAP3K19Q56UN5 1328 aa37.51■■■■□ 3.6
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGEF25Q86VW2 580 aa37.51■■■■□ 3.6
GIPC1-201ENST00000345425 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
GIPC1-201ENST00000345425 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
GIPC1-201ENST00000345425 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
GIPC1-201ENST00000345425 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
GIPC1-201ENST00000345425 KIF24Q5T7B8 1368 aa37.49■■■■□ 3.59
GIPC1-201ENST00000345425 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa37.49■■■■□ 3.59
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA0232Q92628 1395 aa37.49■■■■□ 3.59
GIPC1-201ENST00000345425 MTHFSP49914 203 aa37.47■■■■□ 3.59
GIPC1-201ENST00000345425 AMPHP49418 695 aa37.47■■■■□ 3.59
GIPC1-201ENST00000345425 RTL1A6NKG5 1358 aa37.47■■■■□ 3.59
GIPC1-201ENST00000345425 ZBTB7CA1YPR0 619 aa37.46■■■■□ 3.59
GIPC1-201ENST00000345425 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
GIPC1-201ENST00000345425 PRDM11Q9NQV5 511 aa37.46■■■■□ 3.59
GIPC1-201ENST00000345425 FLT4P35916 1363 aa37.44■■■■□ 3.58
GIPC1-201ENST00000345425 ABCC6O95255 1503 aa37.44■■■■□ 3.58
GIPC1-201ENST00000345425 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
GIPC1-201ENST00000345425 PEAK1Q9H792 1746 aa37.42■■■■□ 3.58
GIPC1-201ENST00000345425 ADAMTS2O95450 1211 aa37.41■■■■□ 3.58
GIPC1-201ENST00000345425 MIER1Q8N108 512 aa37.41■■■■□ 3.58
GIPC1-201ENST00000345425 HOXC9P31274 260 aa37.4■■■■□ 3.58
GIPC1-201ENST00000345425 IP6K1Q92551 441 aa37.4■■■■□ 3.58
GIPC1-201ENST00000345425 CFAP53Q96M91 514 aa37.4■■■■□ 3.58
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