RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 RNF214Q8ND24 703 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 SIL1Q9H173 461 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 OFD1O75665 1012 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 RUFY1Q96T51 708 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 ATP2B2Q01814 1243 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 MNS1Q8NEH6 495 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 CABP4P57796 275 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 NCOA2Q15596 1464 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 MYL6BP14649 208 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 CDK19Q9BWU1 502 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 SLC4A2P04920 1241 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 STAC3Q96MF2 364 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 NEK4P51957 841 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC158Q5M9N0 1113 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 GNAI2P04899 355 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 CAGE1Q8TC20 777 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 STK3Q13188 491 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 TEX35Q5T0J7 233 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 SMC2O95347 1197 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 AK7Q96M32 723 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 CABP1Q9NZU7 370 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRM-201ENST00000332175 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 KRT18P05783 430 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 SKIDA1Q1XH10 827 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 NFKBIBQ15653 356 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 ERC1Q8IUD2 1116 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 KIF21BO75037 1637 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 BCAR3O75815 825 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 AAMPQ13685 434 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 HIP1O00291 1037 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 NASPP49321 788 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM5Q9C035 493 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 KINO60870 393 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 DCAF8L1A6NGE4 600 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 FIBPO43427 364 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.7■■□□□ 1.87
PTPRM-201ENST00000332175 PIP4K2BP78356 416 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC39Q9UFE4 941 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 STK38Q15208 465 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 TXLNAP40222 546 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 CDR1P51861 262 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 SPG7Q9UQ90 795 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC173Q0VFZ6 552 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 NUP133Q8WUM0 1156 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 SYNJ2O15056 1496 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 GCC1Q96CN9 775 aa26.66■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 ZHX3Q9H4I2 956 aa26.66■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 TSPY26PQ9H489 355 aa26.66■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC69A6NI79 296 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 ACBD3Q9H3P7 528 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 TRAK2O60296 914 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 CFTRP13569 1480 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRM-201ENST00000332175 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms