RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 CDK19Q9BWU1 502 aa22.77■■□□□ 1.24
TSPAN17-201ENST00000298564 ALKQ9UM73 1620 aa22.77■■□□□ 1.24
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TSPAN17-201ENST00000298564 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.7■■□□□ 1.22
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TSPAN17-201ENST00000298564 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.64■■□□□ 1.22
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TSPAN17-201ENST00000298564 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.58■■□□□ 1.21
TSPAN17-201ENST00000298564 ZMYM3Q14202 1370 aa22.58■■□□□ 1.2
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TSPAN17-201ENST00000298564 DLC1Q96QB1 1528 aa22.58■■□□□ 1.2
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TSPAN17-201ENST00000298564 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17-201ENST00000298564 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17-201ENST00000298564 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.53■■□□□ 1.2
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TSPAN17-201ENST00000298564 ATP7BP35670 1465 aa22.53■■□□□ 1.2
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TSPAN17-201ENST00000298564 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
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TSPAN17-201ENST00000298564 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.51■■□□□ 1.19
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TSPAN17-201ENST00000298564 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.5■■□□□ 1.19
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TSPAN17-201ENST00000298564 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.49■■□□□ 1.19
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TSPAN17-201ENST00000298564 TRIM27P14373 513 aa22.47■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 TNRQ92752 1358 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.44■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.44■■□□□ 1.18
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