RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285243.6

ANKRD40-201, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD40, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-201ENST00000285243 TESK2Q96S53 571 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD40-201ENST00000285243 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD40-201ENST00000285243 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40-201ENST00000285243 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40-201ENST00000285243 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40-201ENST00000285243 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
ANKRD40-201ENST00000285243 WDR62O43379 1518 aa23.46■■□□□ 1.35
ANKRD40-201ENST00000285243 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.46■■□□□ 1.35
ANKRD40-201ENST00000285243 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
ANKRD40-201ENST00000285243 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.45■■□□□ 1.35
ANKRD40-201ENST00000285243 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.45■■□□□ 1.35
ANKRD40-201ENST00000285243 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 DRC7Q8IY82 874 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 IGHDP01880 384 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM83GA6ND36 823 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 ASXL2Q76L83 1435 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 MRE11P49959 708 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 FCHSD2O94868 740 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 MYL6BP14649 208 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 REC8O95072 547 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 PLCH2O75038 1416 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 ARID3AQ99856 593 aa23.39■■□□□ 1.34
ANKRD40-201ENST00000285243 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 SIL1Q9H173 461 aa23.39■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 NFE2L2Q16236 605 aa23.39■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 MCM4P33991 863 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 FOSBP53539 338 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 APPP05067 770 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 F6X3S4 739 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 CDC45O75419 566 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 SAMD9Q5K651 1589 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 C8orf34Q49A92 452 aa23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 MCTP1Q6DN14 999 aa23.34■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.33■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 NUCB2P80303 420 aa23.33■■□□□ 1.33
ANKRD40-201ENST00000285243 DISP1Q96F81 1524 aa23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 FYB1O15117 783 aa23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 GNAI3P08754 354 aa23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.32■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 GCC1Q96CN9 775 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 KIAA0556O60303 1618 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 KDM6BO15054 1643 aa23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ADAMTS12P58397 1594 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 GNAI2P04899 355 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 KDM4AO75164 1064 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 TNNQ9UQP3 1299 aa23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 NEK4P51957 841 aa23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 G3V3G9 751 aa23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms