RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000105256.9

Ctdsp2-202, Transcript of Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdsp2, Length 4,817 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Paf1Q8K2T8 535 aa20.57■□□□□ 0.88
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Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa20.56■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Mrc2Q64449 1479 aa20.55■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Kcnj4P52189 445 aa20.55■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Plb1Q3TTY0 1478 aa20.55■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Q9D9S1 216 aa20.55■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Znf526Q8BI66 675 aa20.55■□□□□ 0.88
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Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 BicraF8VPZ9 1578 aa20.54■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Cavin1O54724 392 aa20.53■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 L3mbtl2P59178 703 aa20.53■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Fyb1O35601 819 aa20.52■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Rnf187Q8BFX1 236 aa20.52■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Smc4Q8CG47 1286 aa20.52■□□□□ 0.88
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Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Jakmip2D3YXK0 820 aa20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Plekhg5Q66T02 1073 aa20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Krt85Q9Z2T6 507 aa20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 FanciQ8K368 1330 aa20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Paxbp1P58501 919 aa20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gbp4Q61107 620 aa20.5■□□□□ 0.87
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Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ccdc181Q80ZU5 509 aa20.5■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Chmp7Q8R1T1 451 aa20.5■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Trim29Q8R2Q0 587 aa20.49■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gm14025A2AP89 1413 aa20.49■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Lamb3Q61087 1168 aa20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Samm50Q8BGH2 469 aa20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Tubb6Q922F4 447 aa20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 CenpqQ9CPQ5 267 aa20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Top2bQ64511 1612 aa20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Liat1Q810M6 228 aa20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 CenphQ9QYM8 241 aa20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Afap1Q80YS6 731 aa20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Vps53Q8CCB4 832 aa20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Eif5P59325 429 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Slu7Q8BHJ9 585 aa20.46■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Jakmip1Q8BVL9 626 aa20.46■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Camsap1A2AHC3 1581 aa20.45■□□□□ 0.86
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