RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000105256.9

Ctdsp2-202, Transcript of Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdsp2, Length 4,817 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Arhgap5P97393 1501 aa20.63■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Zkscan2G3X952 960 aa20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Bag1Q60739 355 aa20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Usp16Q99LG0 825 aa20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Syce3B5KM66 88 aa20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Fam163aQ8CAA5 168 aa20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Dnaaf4Q8R368 420 aa20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Myom3A2ABU4 1439 aa20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa20.61■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa20.61■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Cog6Q8R3I3 657 aa20.61■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Tiam1Q60610 1591 aa20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Map9Q3TRR0 646 aa20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Fgd6Q69ZL1 1399 aa20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Babam1Q3UI43 333 aa20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gnai1B2RSH2 354 aa20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Nutm1Q8BHP2 1126 aa20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Kif18aQ91WD7 886 aa20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gnai3Q9DC51 354 aa20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 NexnQ7TPW1 607 aa20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 FosbP13346 338 aa20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gm42641I6L9G2 585 aa20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 AtripQ8BMG1 785 aa20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Med4Q9CQA5 270 aa20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Zhx1P70121 873 aa20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Rcan3Q9JKK0 239 aa20.58■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Apaf1O88879 1249 aa20.58■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 MicalclQ9D5U9 680 aa20.58■□□□□ 0.89
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Trim30cD3YVI9 513 aa20.58■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Cnnm3Q32NY4 713 aa20.58■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 ItpripQ3TNL8 555 aa20.57■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Hap1O35668 628 aa20.57■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 ImpactO55091 318 aa20.57■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 AcrbpQ3V140 540 aa20.57■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Paf1Q8K2T8 535 aa20.57■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Hvcn1Q3U2S8 269 aa20.57■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Swt1Q9DBQ9 907 aa20.56■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa20.56■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gcc1Q9D4H2 778 aa20.56■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 AppP12023 770 aa20.55■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Mrc2Q64449 1479 aa20.55■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Kcnj4P52189 445 aa20.55■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Plb1Q3TTY0 1478 aa20.55■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Q9D9S1 216 aa20.55■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Znf526Q8BI66 675 aa20.55■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Mctp1E9PV86 951 aa20.54■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Phldb2Q8K1N2 1249 aa20.54■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Trap1aP19473 224 aa20.54■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Sass6Q80UK7 654 aa20.54■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 SelenooQ9DBC0 667 aa20.54■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 BicraF8VPZ9 1578 aa20.54■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Cavin1O54724 392 aa20.53■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 L3mbtl2P59178 703 aa20.53■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Fyb1O35601 819 aa20.52■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Rnf187Q8BFX1 236 aa20.52■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Smc4Q8CG47 1286 aa20.52■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Il16O54824 1322 aa20.52■□□□□ 0.88
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Kiaa0753Q6A000 959 aa20.52■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 SrrtQ99MR6 875 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Jakmip2D3YXK0 820 aa20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Plekhg5Q66T02 1073 aa20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Krt85Q9Z2T6 507 aa20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 FanciQ8K368 1330 aa20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Paxbp1P58501 919 aa20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gbp4Q61107 620 aa20.5■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Stk38Q91VJ4 465 aa20.5■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ccdc181Q80ZU5 509 aa20.5■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Chmp7Q8R1T1 451 aa20.5■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Trim29Q8R2Q0 587 aa20.49■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gm14025A2AP89 1413 aa20.49■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Lamb3Q61087 1168 aa20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Samm50Q8BGH2 469 aa20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Tubb6Q922F4 447 aa20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 CenpqQ9CPQ5 267 aa20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Top2bQ64511 1612 aa20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Liat1Q810M6 228 aa20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 CenphQ9QYM8 241 aa20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Afap1Q80YS6 731 aa20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Vps53Q8CCB4 832 aa20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Eif5P59325 429 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Slu7Q8BHJ9 585 aa20.46■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Jakmip1Q8BVL9 626 aa20.46■□□□□ 0.87
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Camsap1A2AHC3 1581 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54.5 ms