Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc181Q80ZU5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc181Q80ZU5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccdc181Q80ZU5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccdc181Q80ZU5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc181Q80ZU5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc181Q80ZU5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc181Q80ZU5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc181Q80ZU5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc181Q80ZU5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc181Q80ZU5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc181Q80ZU5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccdc181Q80ZU5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc181Q80ZU5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc181Q80ZU5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc181Q80ZU5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccdc181Q80ZU5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccdc181Q80ZU5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc181Q80ZU5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc181Q80ZU5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc181Q80ZU5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc181Q80ZU5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc181Q80ZU5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc181Q80ZU5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc181Q80ZU5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc181Q80ZU5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc181Q80ZU5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc181Q80ZU5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc181Q80ZU5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc181Q80ZU5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc181Q80ZU5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc181Q80ZU5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc181Q80ZU5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc181Q80ZU5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc181Q80ZU5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc181Q80ZU5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc181Q80ZU5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc181Q80ZU5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc181Q80ZU5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc181Q80ZU5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc181Q80ZU5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc181Q80ZU5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccdc181Q80ZU5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc181Q80ZU5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc181Q80ZU5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc181Q80ZU5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc181Q80ZU5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc181Q80ZU5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc181Q80ZU5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc181Q80ZU5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc181Q80ZU5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc181Q80ZU5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc181Q80ZU5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc181Q80ZU5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc181Q80ZU5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc181Q80ZU5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc181Q80ZU5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc181Q80ZU5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc181Q80ZU5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc181Q80ZU5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc181Q80ZU5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc181Q80ZU5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc181Q80ZU5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc181Q80ZU5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc181Q80ZU5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc181Q80ZU5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc181Q80ZU5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc181Q80ZU5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc181Q80ZU5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc181Q80ZU5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc181Q80ZU5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc181Q80ZU5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc181Q80ZU5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc181Q80ZU5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc181Q80ZU5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc181Q80ZU5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc181Q80ZU5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc181Q80ZU5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc181Q80ZU5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc181Q80ZU5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc181Q80ZU5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc181Q80ZU5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc181Q80ZU5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc181Q80ZU5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc181Q80ZU5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc181Q80ZU5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc181Q80ZU5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc181Q80ZU5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc181Q80ZU5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc181Q80ZU5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc181Q80ZU5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc181Q80ZU5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc181Q80ZU5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc181Q80ZU5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc181Q80ZU5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc181Q80ZU5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc181Q80ZU5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc181Q80ZU5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc181Q80ZU5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc181Q80ZU5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms