RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055211.5

Lrrc3b-201, Transcript of Leucine-rich repeat-containing protein 3B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lrrc3b, Length 1,655 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Col16a1Q8BLX7 1580 aa28.96■■■□□ 2.23
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Col18a1P39061 1774 aa28.95■■■□□ 2.23
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Uspl1Q3ULM6 1089 aa28.95■■■□□ 2.22
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa28.94■■■□□ 2.22
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Golga2Q921M4 999 aa28.93■■■□□ 2.22
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Znf541Q0GGX2 1363 aa28.93■■■□□ 2.22
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Fam135bQ9DAI6 1403 aa28.93■■■□□ 2.22
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Camta1A2A891 1682 aa28.91■■■□□ 2.22
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Kank1E9Q238 1360 aa28.91■■■□□ 2.22
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Tmem2Q5FWI3 1383 aa28.89■■■□□ 2.22
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Rapgef3Q8VCC8 918 aa28.89■■■□□ 2.21
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Ubr1O70481 1757 aa28.89■■■□□ 2.21
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Ttc41Q692V3 1318 aa28.87■■■□□ 2.21
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Tsen2Q6P7W5 460 aa28.87■■■□□ 2.21
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Ap3b2Q9JME5 1082 aa28.87■■■□□ 2.21
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Ppp1r15aP17564 657 aa28.86■■■□□ 2.21
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Scn7aB1AYL1 1681 aa28.86■■■□□ 2.21
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 L3mbtl2P59178 703 aa28.85■■■□□ 2.21
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 CrbnQ8C7D2 445 aa28.85■■■□□ 2.21
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Wnk3Q80XP9 1757 aa28.84■■■□□ 2.21
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Slain2Q8CI08 581 aa28.81■■■□□ 2.2
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Ralbp1Q62172 648 aa28.8■■■□□ 2.2
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Slc12a5Q91V14 1138 aa28.8■■■□□ 2.2
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Sox12Q04890 314 aa28.8■■■□□ 2.2
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 NgefQ8CHT1 710 aa28.79■■■□□ 2.2
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Birc3O08863 600 aa28.78■■■□□ 2.2
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa28.78■■■□□ 2.2
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Map2P20357 1828 aa28.78■■■□□ 2.2
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Fchsd2Q3USJ8 740 aa28.77■■■□□ 2.2
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Erbb3Q61526 1339 aa28.76■■■□□ 2.2
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Spef2Q8C9J3 1734 aa28.76■■■□□ 2.19
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa28.75■■■□□ 2.19
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa28.75■■■□□ 2.19
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa28.72■■■□□ 2.19
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Rad17Q6NXW6 688 aa28.72■■■□□ 2.19
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Rsph6aQ8CDR2 708 aa28.72■■■□□ 2.19
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Ciz1Q8VEH2 845 aa28.72■■■□□ 2.19
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Nlgn1Q99K10 843 aa28.72■■■□□ 2.19
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Ccdc30Q8BVF4 654 aa28.7■■■□□ 2.19
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Dennd6aQ8BH65 605 aa28.7■■■□□ 2.18
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Apaf1O88879 1249 aa28.68■■■□□ 2.18
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Ano8Q6PB70 1060 aa28.68■■■□□ 2.18
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Slc35g1Q8BY79 368 aa28.68■■■□□ 2.18
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Wdr17E9Q271 1322 aa28.68■■■□□ 2.18
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Csrnp3P59055 597 aa28.67■■■□□ 2.18
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Kcna6Q61923 529 aa28.67■■■□□ 2.18
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 PalmQ9Z0P4 383 aa28.67■■■□□ 2.18
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 PtprvP70289 1705 aa28.67■■■□□ 2.18
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Ncoa4Q5U4H9 625 aa28.66■■■□□ 2.18
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Calr4Q3TQS0 420 aa28.65■■■□□ 2.18
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Q4VA45 678 aa28.65■■■□□ 2.18
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Plekhh1Q80TI1 1356 aa28.65■■■□□ 2.18
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa28.64■■■□□ 2.18
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 PaskQ8CEE6 1383 aa28.64■■■□□ 2.17
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Robo1O89026 1612 aa28.63■■■□□ 2.17
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Evi5lH3BKQ3 813 aa28.63■■■□□ 2.17
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 FancaQ9JL70 1439 aa28.63■■■□□ 2.17
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Cavin4A2AMM0 362 aa28.61■■■□□ 2.17
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Eif4a2P10630 407 aa28.61■■■□□ 2.17
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Pip4k2bQ80XI4 416 aa28.61■■■□□ 2.17
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Amigo3Q8C2S7 508 aa28.61■■■□□ 2.17
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa28.6■■■□□ 2.17
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Gimap6Q8K349 305 aa28.59■■■□□ 2.17
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 TimelessQ9R1X4 1197 aa28.59■■■□□ 2.17
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Nfat5Q9WV30 1534 aa28.59■■■□□ 2.17
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Gli3Q61602 1583 aa28.59■■■□□ 2.17
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa28.58■■■□□ 2.17
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Neurod2Q62414 383 aa28.58■■■□□ 2.17
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Dusp27Q148W8 1138 aa28.58■■■□□ 2.16
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Slit2Q9R1B9 1521 aa28.57■■■□□ 2.16
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Atp7bQ64446 1462 aa28.57■■■□□ 2.16
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Farp2Q91VS8 1065 aa28.57■■■□□ 2.16
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Zfp777B9EKF4 885 aa28.56■■■□□ 2.16
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Siglec1Q62230 1695 aa28.55■■■□□ 2.16
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Fyb1O35601 819 aa28.55■■■□□ 2.16
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa28.55■■■□□ 2.16
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Cabp4Q8VHC5 271 aa28.54■■■□□ 2.16
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 DccP70211 1447 aa28.54■■■□□ 2.16
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Atf3Q60765 181 aa28.54■■■□□ 2.16
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Ptpn23Q6PB44 1692 aa28.53■■■□□ 2.16
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Atxn3Q9CVD2 355 aa28.52■■■□□ 2.16
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Swt1Q9DBQ9 907 aa28.49■■■□□ 2.15
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Hoxc9P09633 260 aa28.48■■■□□ 2.15
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Parp14Q2EMV9 1817 aa28.47■■■□□ 2.15
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Kcnh5Q920E3 988 aa28.47■■■□□ 2.15
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Tet3Q8BG87 1668 aa28.47■■■□□ 2.15
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Gas2l2Q5SSG4 860 aa28.45■■■□□ 2.15
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa28.45■■■□□ 2.14
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Brinp3Q499E0 766 aa28.43■■■□□ 2.14
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Zmym3Q9JLM4 1370 aa28.42■■■□□ 2.14
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 Rwdd1Q9CQK7 243 aa28.42■■■□□ 2.14
Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 GnpatP98192 678 aa28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9 ms