RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027809.7

Opn3-201, Transcript of Opsin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Opn3, Length 1,913 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3-201ENSMUST00000027809 Pik3c2aQ61194 1686 aa29.16■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 Uspl1Q3ULM6 1089 aa29.15■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mdc1Q5PSV9 1707 aa29.15■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 Col16a1Q8BLX7 1580 aa29.14■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tsen2Q6P7W5 460 aa29.14■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 L3mbtl2P59178 703 aa29.13■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 CemipQ8BI06 1361 aa29.12■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Csrnp3P59055 597 aa29.12■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Znf541Q0GGX2 1363 aa29.11■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa29.1■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fam135bQ9DAI6 1403 aa29.1■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ap3b2Q9JME5 1082 aa29.09■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ttc41Q692V3 1318 aa29.09■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Sox12Q04890 314 aa29.08■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Birc3O08863 600 aa29.07■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ppp1r15aP17564 657 aa29.07■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 NgefQ8CHT1 710 aa29.07■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tmem2Q5FWI3 1383 aa29.06■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa29.06■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Scn7aB1AYL1 1681 aa29.05■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ubr1O70481 1757 aa29.05■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Erbb3Q61526 1339 aa29.04■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ralbp1Q62172 648 aa29.04■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa29.04■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Col18a1P39061 1774 aa29.04■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Calr4Q3TQS0 420 aa29.02■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Slc12a5Q91V14 1138 aa29.02■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Camta1A2A891 1682 aa29.01■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa29.01■■■□□ 2.23
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rapgef3Q8VCC8 918 aa29■■■□□ 2.23
Opn3-201ENSMUST00000027809 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa29■■■□□ 2.23
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ccdc30Q8BVF4 654 aa28.98■■■□□ 2.23
Opn3-201ENSMUST00000027809 Slain2Q8CI08 581 aa28.96■■■□□ 2.23
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fchsd2Q3USJ8 740 aa28.96■■■□□ 2.23
Opn3-201ENSMUST00000027809 Wnk3Q80XP9 1757 aa28.95■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Plekhh1Q80TI1 1356 aa28.95■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa28.94■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Apaf1O88879 1249 aa28.94■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rsph6aQ8CDR2 708 aa28.94■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 PalmQ9Z0P4 383 aa28.93■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Spef2Q8C9J3 1734 aa28.93■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Map2P20357 1828 aa28.93■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Dennd6aQ8BH65 605 aa28.92■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ciz1Q8VEH2 845 aa28.91■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Neurod2Q62414 383 aa28.9■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nlgn1Q99K10 843 aa28.9■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa28.9■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 FancaQ9JL70 1439 aa28.88■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 Slc35g1Q8BY79 368 aa28.87■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 PaskQ8CEE6 1383 aa28.87■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 Wdr17E9Q271 1322 aa28.86■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 PtprvP70289 1705 aa28.85■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cavin4A2AMM0 362 aa28.85■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 Evi5lH3BKQ3 813 aa28.85■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 Q4VA45 678 aa28.84■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa28.84■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rad17Q6NXW6 688 aa28.84■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 Eif4a2P10630 407 aa28.82■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Dusp27Q148W8 1138 aa28.82■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kcna6Q61923 529 aa28.82■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Pip4k2bQ80XI4 416 aa28.82■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa28.82■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Robo1O89026 1612 aa28.81■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ano8Q6PB70 1060 aa28.81■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Atp7bQ64446 1462 aa28.8■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Atxn3Q9CVD2 355 aa28.8■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ncoa4Q5U4H9 625 aa28.79■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nfat5Q9WV30 1534 aa28.77■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fyb1O35601 819 aa28.77■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cabp4Q8VHC5 271 aa28.77■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa28.77■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 TimelessQ9R1X4 1197 aa28.77■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gimap6Q8K349 305 aa28.76■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Slit2Q9R1B9 1521 aa28.76■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Aplp2Q06335 707 aa28.75■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Farp2Q91VS8 1065 aa28.75■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cyb5rlB1AS42 316 aa28.73■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zfp777B9EKF4 885 aa28.73■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gas2l2Q5SSG4 860 aa28.73■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Atf3Q60765 181 aa28.73■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Swt1Q9DBQ9 907 aa28.72■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Siglec1Q62230 1695 aa28.72■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ptpn23Q6PB44 1692 aa28.72■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Amigo3Q8C2S7 508 aa28.71■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gli3Q61602 1583 aa28.71■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rwdd1Q9CQK7 243 aa28.7■■■□□ 2.18
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa28.68■■■□□ 2.18
Opn3-201ENSMUST00000027809 Hoxc9P09633 260 aa28.68■■■□□ 2.18
Opn3-201ENSMUST00000027809 DccP70211 1447 aa28.68■■■□□ 2.18
Opn3-201ENSMUST00000027809 MpripP97434 1024 aa28.67■■■□□ 2.18
Opn3-201ENSMUST00000027809 Parp14Q2EMV9 1817 aa28.66■■■□□ 2.18
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mcm10Q0VBD2 885 aa28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.6 ms