RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C COX8P04039 78 aa1.14□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa1.14□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C HFA1P32874 2273 aa1.13□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C YGL014C-AP0C5N1 53 aa1.13□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C OLI1P61829 76 aa1.13□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C SOM1Q05676 74 aa1.13□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C YDR034C-AP0C289 58 aa1.12□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C YEL014CP39999 101 aa1.12□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C YJR128WP47162 119 aa1.12□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C YGR146C-AQ8TGT9 53 aa1.12□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C URA2P07259 2214 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C TOM1Q03280 3268 aa1.12□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C TAO3P40468 2376 aa1.12□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C VPS13Q07878 3144 aa1.11□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C YJL197C-AP0C5P0 93 aa1.11□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa1.11□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C YBL044WP38194 122 aa1.1□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C FYV12Q08559 129 aa1.1□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C IRA2P19158 3079 aa1.09□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C YLR255CO13574 117 aa1.09□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C YHR073W-AP0C5N7 58 aa1.09□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C YOR316C-AQ3E806 69 aa1.09□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
CSE4YKL049C RPL43BP0CX26 92 aa1.08□□□□□ -2.24
CSE4YKL049C COX7P10174 60 aa1.08□□□□□ -2.24
CSE4YKL049C YCL042WP25572 119 aa1.08□□□□□ -2.24
CSE4YKL049C LCL1Q02786 101 aa1.07□□□□□ -2.24
CSE4YKL049C RPL37BP51402 88 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
CSE4YKL049C YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa1.06□□□□□ -2.24
CSE4YKL049C CSF1Q12150 2958 aa1.05□□□□□ -2.24
CSE4YKL049C YBR016WP38216 128 aa1.05□□□□□ -2.24
CSE4YKL049C YCR108CQ3E819 63 aa1.05□□□□□ -2.24
CSE4YKL049C YBR056W-AI2HB52 66 aa1.04□□□□□ -2.24
CSE4YKL049C FMP27Q06179 2628 aa1.03□□□□□ -2.24
CSE4YKL049C YDR210WQ03482 75 aa1.02□□□□□ -2.25
CSE4YKL049C YOR072W-BQ3E832 53 aa1.02□□□□□ -2.25
CSE4YKL049C YJL009WP47078 108 aa1.01□□□□□ -2.25
CSE4YKL049C CMC4Q3E7A9 73 aa1.01□□□□□ -2.25
CSE4YKL049C YPR117WQ06116 2489 aa1□□□□□ -2.25
CSE4YKL049C HHY1P39982 102 aa1□□□□□ -2.25
CSE4YKL049C YBR072C-AQ3E794 53 aa1□□□□□ -2.25
CSE4YKL049C IRA1P18963 3092 aa1□□□□□ -2.25
CSE4YKL049C RPL37AP49166 88 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
CSE4YKL049C YML054C-AQ3E809 52 aa0.98□□□□□ -2.25
CSE4YKL049C GCN1P33892 2672 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
CSE4YKL049C PRP8P33334 2413 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
CSE4YKL049C Q0017Q9ZZX8 53 aa0.95□□□□□ -2.26
CSE4YKL049C MEC1P38111 2368 aa0.94□□□□□ -2.26
CSE4YKL049C TRA1P38811 3744 aa0.94□□□□□ -2.26
CSE4YKL049C UTP20P35194 2493 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
CSE4YKL049C CUP1-1P0CX80 61 aa0.93□□□□□ -2.26
CSE4YKL049C CUP1-2P0CX81 61 aa0.93□□□□□ -2.26
CSE4YKL049C TOR2P32600 2474 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
CSE4YKL049C TEL1P38110 2787 aa0.89□□□□□ -2.27
CSE4YKL049C YOL164W-AQ3E7A5 60 aa0.85□□□□□ -2.27
CSE4YKL049C TOR1P35169 2470 aa0.84□□□□□ -2.27
CSE4YKL049C NUM1Q00402 2748 aa0.83□□□□□ -2.28
CSE4YKL049C YHR050W-AQ05451 56 aa0.81□□□□□ -2.28
CSE4YKL049C YLR157W-EP0CF00 54 aa0.75□□□□□ -2.29
CSE4YKL049C DYN1P36022 4092 aa0.74□□□□□ -2.29
CSE4YKL049C RPS29AP41057 56 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
CSE4YKL049C RPS29BP41058 56 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
CSE4YKL049C MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
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