RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A MON2P48563 1636 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
YHL009W-AYHL009W-A BUD3P25558 1636 aa0.03□□□□□ -2.4
YHL009W-AYHL009W-A YLL006W-AQ3E814 58 aa0.03□□□□□ -2.4
YHL009W-AYHL009W-A YOR072W-BQ3E832 53 aa0.03□□□□□ -2.4
YHL009W-AYHL009W-A YGL258W-AQ3E740 77 aa0.02□□□□□ -2.41
YHL009W-AYHL009W-A USO1P25386 1790 aa0.01□□□□□ -2.41
YHL009W-AYHL009W-A NUP192P47054 1683 aa0.01□□□□□ -2.41
YHL009W-AYHL009W-A YOR192C-CQ3E736 78 aa0□□□□□ -2.41
YHL009W-AYHL009W-A YPR010C-AA5Z2X5 72 aa-0.02□□□□□ -2.41
YHL009W-AYHL009W-A FIG2P25653 1609 aa-0.02□□□□□ -2.41
YHL009W-AYHL009W-A ULS1Q08562 1619 aa-0.02□□□□□ -2.41
YHL009W-AYHL009W-A STU1P38198 1513 aa-0.03□□□□□ -2.41
YHL009W-AYHL009W-A YHR050W-AQ05451 56 aa-0.03□□□□□ -2.41
YHL009W-AYHL009W-A RKR1Q04781 1562 aa-0.03□□□□□ -2.41
YHL009W-AYHL009W-A FMP27Q06179 2628 aa-0.03□□□□□ -2.41
YHL009W-AYHL009W-A HIR3P47171 1648 aa-0.04□□□□□ -2.42
YHL009W-AYHL009W-A THO2P53552 1597 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
YHL009W-AYHL009W-A TOR2P32600 2474 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
YHL009W-AYHL009W-A NUP170P38181 1502 aa-0.04□□□□□ -2.42
YHL009W-AYHL009W-A ATG2P53855 1592 aa-0.06□□□□□ -2.42
YHL009W-AYHL009W-A PEP1P32319 1579 aa-0.06□□□□□ -2.42
YHL009W-AYHL009W-A YOR316C-AQ3E806 69 aa-0.07□□□□□ -2.42
YHL009W-AYHL009W-A GCN2P15442 1659 aa-0.08□□□□□ -2.42
YHL009W-AYHL009W-A MEC1P38111 2368 aa-0.09□□□□□ -2.42
YHL009W-AYHL009W-A YPR117WQ06116 2489 aa-0.09□□□□□ -2.42
YHL009W-AYHL009W-A FLO1P32768 1537 aa-0.09□□□□□ -2.42
YHL009W-AYHL009W-A COX9P07255 59 aa-0.13□□□□□ -2.43
YHL009W-AYHL009W-A YDR034C-AP0C289 58 aa-0.14□□□□□ -2.43
YHL009W-AYHL009W-A RPL29P05747 59 aaPredicted RBP-0.15□□□□□ -2.43
YHL009W-AYHL009W-A DDR2P89113 61 aa-0.15□□□□□ -2.43
YHL009W-AYHL009W-A TEL1P38110 2787 aa-0.15□□□□□ -2.43
YHL009W-AYHL009W-A YJL133C-AQ3E7A3 74 aa-0.17□□□□□ -2.44
YHL009W-AYHL009W-A Q0017Q9ZZX8 53 aa-0.17□□□□□ -2.44
YHL009W-AYHL009W-A YML054C-AQ3E809 52 aa-0.19□□□□□ -2.44
YHL009W-AYHL009W-A YLR342W-AQ3E810 57 aa-0.19□□□□□ -2.44
YHL009W-AYHL009W-A GCN1P33892 2672 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
YHL009W-AYHL009W-A YBR056W-AI2HB52 66 aa-0.21□□□□□ -2.44
YHL009W-AYHL009W-A YHR073W-AP0C5N7 58 aa-0.22□□□□□ -2.44
YHL009W-AYHL009W-A DYN1P36022 4092 aa-0.27□□□□□ -2.45
YHL009W-AYHL009W-A SMX2P40204 77 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
YHL009W-AYHL009W-A YJL127C-BQ3E828 52 aa-0.29□□□□□ -2.46
YHL009W-AYHL009W-A CHC1P22137 1653 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
YHL009W-AYHL009W-A MLP2P40457 1679 aa-0.3□□□□□ -2.46
YHL009W-AYHL009W-A CSF1Q12150 2958 aa-0.32□□□□□ -2.46
YHL009W-AYHL009W-A CUP1-1P0CX80 61 aa-0.33□□□□□ -2.46
YHL009W-AYHL009W-A CUP1-2P0CX81 61 aa-0.33□□□□□ -2.46
YHL009W-AYHL009W-A IRA1P18963 3092 aa-0.33□□□□□ -2.46
YHL009W-AYHL009W-A NUM1Q00402 2748 aa-0.34□□□□□ -2.46
YHL009W-AYHL009W-A YMR105W-AQ8TGS8 64 aa-0.35□□□□□ -2.47
YHL009W-AYHL009W-A PMP3P87284 55 aa-0.36□□□□□ -2.47
YHL009W-AYHL009W-A MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
YHL009W-AYHL009W-A TRA1P38811 3744 aa-0.38□□□□□ -2.47
YHL009W-AYHL009W-A HOR7Q05827 59 aa-0.41□□□□□ -2.48
YHL009W-AYHL009W-A TOM7P53507 60 aa-0.44□□□□□ -2.48
YHL009W-AYHL009W-A IRA2P19158 3079 aa-0.48□□□□□ -2.49
YHL009W-AYHL009W-A VPS13Q07878 3144 aa-0.49□□□□□ -2.49
YHL009W-AYHL009W-A YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-AYHL009W-A NCE101Q02820 53 aa-0.62□□□□□ -2.51
YHL009W-AYHL009W-A TOM1Q03280 3268 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-AYHL009W-A RPL39P04650 51 aa-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-AYHL009W-A YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-AYHL009W-A Q0297Q9ZZV8 51 aa-1.11□□□□□ -2.59
YHL009W-AYHL009W-A YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa-1.75□□□□□ -2.69
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