RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
NTF2YER009W CWP2P43497 92 aa-0.55□□□□□ -2.5
NTF2YER009W YGR035W-AQ45U48 73 aa-0.55□□□□□ -2.5
NTF2YER009W SSK2P53599 1579 aa-0.55□□□□□ -2.5
NTF2YER009W IRA2P19158 3079 aa-0.55□□□□□ -2.5
NTF2YER009W SWM2P40342 146 aa-0.56□□□□□ -2.5
NTF2YER009W ZEO1Q08245 113 aa-0.56□□□□□ -2.5
NTF2YER009W YMR175W-AQ3E766 64 aa-0.56□□□□□ -2.5
NTF2YER009W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
NTF2YER009W HIR3P47171 1648 aa-0.56□□□□□ -2.5
NTF2YER009W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
NTF2YER009W SPI1P40092 148 aa-0.57□□□□□ -2.5
NTF2YER009W ERI1P62651 68 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
NTF2YER009W BCK1Q01389 1478 aa-0.57□□□□□ -2.5
NTF2YER009W YCR075W-AQ3E830 75 aa-0.58□□□□□ -2.5
NTF2YER009W USO1P25386 1790 aa-0.58□□□□□ -2.5
NTF2YER009W VPS13Q07878 3144 aa-0.58□□□□□ -2.5
NTF2YER009W UFD4P33202 1483 aa-0.59□□□□□ -2.5
NTF2YER009W SCC2Q04002 1493 aa-0.59□□□□□ -2.5
NTF2YER009W YOL131WQ08270 108 aa-0.59□□□□□ -2.5
NTF2YER009W CDC25P04821 1589 aa-0.59□□□□□ -2.5
NTF2YER009W BUD3P25558 1636 aa-0.6□□□□□ -2.5
NTF2YER009W YOR316C-AQ3E806 69 aa-0.6□□□□□ -2.51
NTF2YER009W YHR073W-AP0C5N7 58 aa-0.61□□□□□ -2.51
NTF2YER009W YSY6P38374 65 aa-0.61□□□□□ -2.51
NTF2YER009W STU1P38198 1513 aa-0.61□□□□□ -2.51
NTF2YER009W YPR010C-AA5Z2X5 72 aa-0.62□□□□□ -2.51
NTF2YER009W YJL133C-AQ3E7A3 74 aa-0.62□□□□□ -2.51
NTF2YER009W ATG2P53855 1592 aa-0.62□□□□□ -2.51
NTF2YER009W YFL041W-AQ3E817 63 aa-0.63□□□□□ -2.51
NTF2YER009W MYO4P32492 1471 aa-0.63□□□□□ -2.51
NTF2YER009W NUP159P40477 1460 aa-0.64□□□□□ -2.51
NTF2YER009W YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa-0.64□□□□□ -2.51
NTF2YER009W NUP192P47054 1683 aa-0.65□□□□□ -2.51
NTF2YER009W YIL102C-AQ2V2P5 75 aa-0.65□□□□□ -2.51
NTF2YER009W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
NTF2YER009W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.51
NTF2YER009W PAI3P01094 68 aa-0.67□□□□□ -2.52
NTF2YER009W DDR2P89113 61 aa-0.67□□□□□ -2.52
NTF2YER009W YHR213W-AQ8TGT4 77 aa-0.67□□□□□ -2.52
NTF2YER009W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
NTF2YER009W TOM1Q03280 3268 aa-0.7□□□□□ -2.52
NTF2YER009W RKR1Q04781 1562 aa-0.7□□□□□ -2.52
NTF2YER009W COX9P07255 59 aa-0.71□□□□□ -2.52
NTF2YER009W YLR342W-AQ3E810 57 aa-0.71□□□□□ -2.52
NTF2YER009W YJL127C-BQ3E828 52 aa-0.71□□□□□ -2.52
NTF2YER009W NUP170P38181 1502 aa-0.71□□□□□ -2.52
NTF2YER009W PMP3P87284 55 aa-0.73□□□□□ -2.53
NTF2YER009W PEP1P32319 1579 aa-0.74□□□□□ -2.53
NTF2YER009W MLP2P40457 1679 aa-0.74□□□□□ -2.53
NTF2YER009W YKL023C-AQ2V2P3 75 aa-0.76□□□□□ -2.53
NTF2YER009W VMA9Q3E7B6 73 aa-0.77□□□□□ -2.53
NTF2YER009W YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa-0.78□□□□□ -2.53
NTF2YER009W SMX2P40204 77 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
NTF2YER009W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
NTF2YER009W TOM7P53507 60 aa-0.81□□□□□ -2.54
NTF2YER009W HOR7Q05827 59 aa-0.81□□□□□ -2.54
NTF2YER009W YFR010W-AP0C5N0 62 aa-0.83□□□□□ -2.54
NTF2YER009W NCE101Q02820 53 aa-0.97□□□□□ -2.56
NTF2YER009W RPL39P04650 51 aa-0.99□□□□□ -2.57
NTF2YER009W Q0297Q9ZZV8 51 aa-1.02□□□□□ -2.57
NTF2YER009W YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa-1.16□□□□□ -2.6
NTF2YER009W YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa-1.35□□□□□ -2.63
Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.4 ms