RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A KAP122P32767 1081 aa1.56□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A GAS5Q08193 484 aa1.56□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A HSE1P38753 452 aa1.56□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A PRP43P53131 767 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A MLF3P32047 452 aa1.55□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A KNS1P32350 737 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A VTC4P47075 721 aa1.55□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A YNR063WP53749 607 aa1.55□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A FRA1Q07825 749 aa1.55□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A RGP1P16664 663 aa1.55□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A PRE9P23638 258 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A ISW1P38144 1129 aa1.55□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A WHI3P34761 661 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A GUA1P38625 525 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A QDR2P40474 542 aa1.54□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A CDC55Q00362 526 aa1.54□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A YDR215CQ12240 137 aa1.54□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A GAS1P22146 559 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A DYS1P38791 387 aa1.54□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A MSB1P21339 1137 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A SQT1P35184 431 aa1.53□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A BIM1P40013 344 aa1.53□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A HPC2Q01448 625 aa1.53□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A GIC2Q06648 383 aa1.53□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A ENO2P00925 437 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A FUR4P05316 633 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A AIM46P38885 310 aa1.53□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A GIP2P40036 548 aa1.53□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A SDH1Q00711 640 aa1.53□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A PKC1P24583 1151 aa1.53□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A ISC10P32645 267 aa1.53□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A UBA2P52488 636 aa1.53□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A TSC13Q99190 310 aa1.53□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A YHL008CP38750 627 aa1.52□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A GAS4Q08271 471 aa1.52□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A SPT2P06843 333 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A ADP1P25371 1049 aa1.52□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A AIM26P32858 118 aa1.52□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A SCD5P34758 872 aa1.52□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A GTS1P40956 396 aa1.52□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A RCM1P53972 490 aa1.52□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A NBA1Q08229 501 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A PSH1Q12161 406 aa1.52□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A ENO1P00924 437 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A KTR1P27810 393 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A NAM7P30771 971 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A YKL077WP36081 392 aa1.51□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A SLX8P40072 274 aa1.51□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A NFS1P25374 497 aa1.51□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A CCP1P00431 361 aa1.51□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A PRO1P32264 428 aa1.51□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A RSM26P47141 266 aa1.51□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A DSE4P53753 1117 aa1.51□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A SIS2P36024 562 aa1.5□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A FET4P40988 552 aa1.5□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A MMM1P41800 426 aa1.5□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A SPO71Q03868 1245 aa1.5□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A SSA4P22202 642 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A SPT20P50875 604 aa1.5□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP1.5□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A DED1P06634 604 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A CPS1P27614 576 aa1.5□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A SAF1P38352 637 aa1.5□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A KIP3P53086 805 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A BIO2P32451 375 aa1.49□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A SHU2P38957 223 aa1.49□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A PHO87P25360 923 aa1.49□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A DOT1Q04089 582 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A URN1Q06525 465 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A SKN7P38889 622 aa1.48□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A UBP5P39944 805 aa1.48□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A PRK1P40494 810 aa1.48□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A BRE4Q07660 1125 aa1.48□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A RAD55P38953 406 aa1.48□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A ATG32P40458 529 aa1.48□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A MTR4P47047 1073 aaKnown RBP1.48□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A TPP1Q03796 238 aa1.48□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A AOS1Q06624 347 aa1.48□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A ELG1Q12050 791 aa1.48□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A APM2P38700 605 aa1.48□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A UTP13Q05946 817 aaKnown RBP1.48□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data1.48□□□□□ -2.17not detected
YPL060C-AYPL060C-A YOR223WQ12015 292 aa1.48□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A COQ4O13525 335 aa1.47□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A TIF1P10081 395 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A GLO3P38682 493 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A YFL066CP43538 392 aa1.47□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A SPO74P45819 413 aa1.47□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A PEP7P32609 515 aa1.47□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A SFA1P32771 386 aa1.47□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A SMC1P32908 1225 aa1.47□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A PTC7P38797 343 aa1.47□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A HAL5P38970 855 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A CIT3P43635 486 aa1.47□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A ECL1P48235 211 aa1.47□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A ARI1P53111 347 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A BUD9P53226 547 aa1.47□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A KAR5Q04746 504 aa1.47□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A LAP2Q10740 671 aa1.47□□□□□ -2.17
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