RNA–Protein interactions for RNA: YML039W

YML039W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YML039W, Length 5,268 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML039WYML039W RTG2P32608 588 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W SKG6P32900 734 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W OCT1P35999 772 aa2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W HGH1P48362 394 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W SPO1P53541 631 aa2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W HIF1Q12373 385 aa2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W RTP1Q12751 981 aa2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W REB1P21538 810 aa2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W GEF1P37020 779 aa2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W ENT3P47160 408 aa2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W RNT1Q02555 471 aa2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W SPO20Q04359 397 aa2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W THI22Q06490 572 aa2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W RAD4P14736 754 aa2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W SDH2P21801 266 aa2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W GRS1P38088 690 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W YNG2P38806 282 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W VPS8P39702 1274 aa2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W YGL140CP53120 1219 aa2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W YDL073WQ07454 984 aa2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
YML039WYML039W SIR4P11978 1358 aa2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W CET1O13297 549 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W VPS29P38759 282 aa2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W PSP2P50109 593 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W YOR131CQ12486 218 aa2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W PDR18P53756 1333 aa2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W VPS3P23643 1011 aa2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W RPC53P25441 422 aa2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W TEA1P47988 759 aa2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W HEM1P09950 548 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W CDC48P25694 835 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W PFF1P38244 976 aa2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W GGA2P38817 585 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W SMC5Q08204 1093 aa2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W VHS3Q08438 674 aa2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W NYV1Q12255 253 aa2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W TRP2P00899 507 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W PRP9P19736 530 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W ATG3P40344 310 aa2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W CWH41P53008 833 aa2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W DUS1P53759 423 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W RCM1P53972 490 aa2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W CTI6Q08923 506 aa2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W HAT1Q12341 374 aa2.98□□□□□ -1.93
YML039WYML039W TSC11P40061 1430 aa2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W PER1P25625 357 aa2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W XRS2P33301 854 aa2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W ISW1P38144 1129 aa2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W MSR1P38714 643 aa2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W AIM9P40053 627 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W OPY2Q06810 360 aa2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W TIM23P32897 222 aa2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W SQT1P35184 431 aa2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W TIF5P38431 405 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W VMA13P41807 478 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W PDS5Q04264 1277 aa2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W RTC1Q08281 1341 aa2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W OSH3P38713 996 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W ESC2Q06340 456 aa2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W DPH6Q12429 685 aa2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W MPH3P0CE00 602 aa2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W YBL028CP38202 106 aa2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W BBC1P47068 1157 aa2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W CPR6P53691 371 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W HXT15P54854 567 aa2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W PRO2P54885 456 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W MMR1Q06324 491 aa2.97□□□□□ -1.93
YML039WYML039W TAF13P11747 167 aa2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W APP1P53933 587 aa2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W FAR10Q06001 478 aa2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W RRP6Q12149 733 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W ZRT2Q12436 422 aa2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W STN1P38960 494 aa2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W UBP12P39538 1254 aa2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W ALD5P40047 520 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W BNI5P53890 448 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W RPO31P04051 1460 aa2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W SNT2P53127 1403 aa2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W RAD3P06839 778 aa2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W HSC82P15108 705 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W MCM5P29496 775 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W SEC21P32074 935 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W SAC6P32599 642 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W RTS1P38903 757 aa2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W BFA1P47113 574 aa2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W GYP7P48365 746 aa2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W FAR11P53917 953 aa2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W RBA50Q04418 439 aa2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
YML039WYML039W PSR2Q07949 397 aa2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 59.6 ms