RNA–Protein interactions for RNA: YKR078W

YKR078W, Transcript of Cytoplasmic protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR078W, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR078WYKR078W YNR040WP53736 256 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR078WYKR078W HEH2Q03281 663 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR078WYKR078W TDA6Q06466 467 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR078WYKR078W PUN1Q06991 263 aa5.21□□□□□ -1.57
YKR078WYKR078W MRPL33P20084 86 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W VMA3P25515 160 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W ALD4P46367 519 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W YNR014WP53719 212 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W FOX2Q02207 900 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W RLF2Q12495 606 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W NCL1P38205 684 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W APM2P38700 605 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W LSB3P43603 459 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data5.19□□□□□ -1.58not detected
YKR078WYKR078W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W BOI2P39969 1040 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W PRK1P40494 810 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W YPR053CQ6Q5F3 151 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W SRS2P12954 1174 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W ISC10P32645 267 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W MET1P36150 593 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W YMR187CQ03236 431 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W SKN7P38889 622 aa5.17□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W CCT8P47079 568 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W DYS1P38791 387 aa5.16□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W ITC1P53125 1264 aa5.16□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W LDH1P38139 375 aa5.16□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W YOR296WQ08748 1289 aa5.16□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W YCK2P23292 546 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W TPS3P38426 1054 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
YKR078WYKR078W BSD2P38356 321 aa5.14□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W PNP1Q05788 311 aa5.14□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W PGM2P37012 569 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W GIP1P38229 639 aa5.14□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W YDR215CQ12240 137 aa5.14□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W MRP10O75012 95 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W IDI1P15496 288 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W ALG14P38242 237 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W MSN1P22148 382 aa5.12□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W NAR1P23503 491 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W YER156CP40093 338 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W NHA1Q99271 985 aa5.12□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W BOI1P38041 980 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W ISW1P38144 1129 aa5.11□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W GIS4Q04233 774 aa5.11□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W RRN6P32786 894 aa5.11□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W KTR2P33550 425 aa5.09□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W YIL165CP40446 119 aa5.09□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W HXT8P40886 569 aa5.09□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W PRY1P47032 299 aa5.09□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W APC11Q12157 165 aa5.09□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W LSO1Q3E827 93 aa5.09□□□□□ -1.59
YKR078WYKR078W BUD9P53226 547 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W MCA1Q08601 432 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W TAT1P38085 619 aa5.07□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W BOL3P39724 118 aa5.07□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W SUT1P53032 299 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W FIR1P40020 876 aa5.06□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W RGD2P43556 714 aa5.06□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W RSC2Q06488 889 aa5.06□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W FUR4P05316 633 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W LSB6P42951 607 aa5.06□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W PPT1P53043 513 aa5.06□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W RPB10P22139 70 aa5.05□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W YBR287WP38355 427 aa5.05□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W YJL181WP46987 611 aa5.05□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W RRM3P38766 723 aa5.04□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W AIM46P38885 310 aa5.04□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W GAS5Q08193 484 aa5.04□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W GIP2P40036 548 aa5.04□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W NTA1P40354 457 aa5.04□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W SOK2P53438 785 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W SLP1Q12232 587 aa5.04□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W INP51P40559 946 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W YPL034WQ03083 165 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR078WYKR078W AI3P03877 415 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR078WYKR078W RAD55P38953 406 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR078WYKR078W TED1P40533 473 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR078WYKR078W SBP1P10080 294 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
YKR078WYKR078W SMC1P32908 1225 aa5.01□□□□□ -1.61
YKR078WYKR078W BIO5P53744 561 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
YKR078WYKR078W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
YKR078WYKR078W KAR5Q04746 504 aa5.01□□□□□ -1.61
YKR078WYKR078W SAC7P17121 654 aa5□□□□□ -1.61
YKR078WYKR078W SFA1P32771 386 aa5□□□□□ -1.61
YKR078WYKR078W IRS4P36115 615 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
YKR078WYKR078W PSY2P40164 858 aa5□□□□□ -1.61
YKR078WYKR078W ALD3P54114 506 aa5□□□□□ -1.61
YKR078WYKR078W SSA1P10591 642 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
YKR078WYKR078W TFA2P36145 328 aa4.99□□□□□ -1.61
YKR078WYKR078W SOG2Q08817 791 aa4.99□□□□□ -1.61
YKR078WYKR078W GLO3P38682 493 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58.6 ms