RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TTI1	YKL033W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TTI1	YKL033W	SWI5	P08153	709 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	BIM1	P40013	344 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	ATG32	P40458	529 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	PSH1	Q12161	406 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	MRPL16	P38064	232 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	STB3	Q12427	513 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	FPS1	P23900	669 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	MRX10	Q05648	414 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	YPQ2	Q06328	317 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	TDA6	Q06466	467 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	LTE1	P07866	1435 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	NTH2	P35172	780 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	KTR7	P40504	517 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	DNF2	Q12675	1612 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	YNR014W	P53719	212 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	YNL165W	P53891	406 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	SPO14	P36126	1683 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	YFL034W	P43564	1073 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	YTA6	P40328	754 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	YMR187C	Q03236	431 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	SSN2	P38931	1420 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	MLF3	P32047	452 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	PEP12	P32854	288 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	BOI2	P39969	1040 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	ALD2	P47771	506 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	TSC13	Q99190	310 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	CYT1	P07143	309 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	SPR3	P41901	512 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.98
TTI1	YKL033W	DOP1	Q03921	1698 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	MCM1	P11746	286 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	YOR093C	Q12275	1648 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	CHD1	P32657	1468 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	RGP1	P16664	663 aa		2.64	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	PAN1	P32521	1480 aa		2.64	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	SKN7	P38889	622 aa		2.64	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	MTO1	P53070	669 aa		2.64	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	MSC7	P38694	644 aa		2.63	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	YDR215C	Q12240	137 aa		2.63	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	MLP2	P40457	1679 aa		2.63	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	MET1	P36150	593 aa		2.62	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	MCA1	Q08601	432 aa		2.62	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	TAF2	P23255	1407 aa		2.62	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	PHO87	P25360	923 aa		2.62	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	PRY1	P47032	299 aa		2.62	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.62	□□□□□ -1.99	not detected
TTI1	YKL033W	GAS4	Q08271	471 aa		2.62	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	HAP1	P0CE41	1502 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	HAP4	P14064	554 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	POL1	P13382	1468 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	GAL2	P13181	574 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	TAT1	P38085	619 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	PRK1	P40494	810 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	ROM1	P53046	1155 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	UFD4	P33202	1483 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	PDR12	Q02785	1511 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	UBP1	P25037	809 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	KAP122	P32767	1081 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	ALG14	P38242	237 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	HXT5	P38695	592 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	SNT2	P53127	1403 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	SMC4	Q12267	1418 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	YNR040W	P53736	256 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TTI1	YKL033W	YOR1	P53049	1477 aa		2.59	□□□□□ -2
TTI1	YKL033W	VAN1	P23642	535 aa		2.59	□□□□□ -2
TTI1	YKL033W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2

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