RNA–Protein interactions for RNA: YHR154W

RTT107, Transcript of Protein implicated in Mms22-dependent DNA repair during S phase, yeast

Gene RTT107, Length 3,213 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTT107	YHR154W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
RTT107	YHR154W	TRK2	P28584	889 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RTT107	YHR154W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
RTT107	YHR154W	APP1	P53933	587 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RTT107	YHR154W	PUS5	Q06244	254 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RTT107	YHR154W	EDE1	P34216	1381 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RTT107	YHR154W	YHL050C	P38721	697 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RTT107	YHR154W	YHR219W	P38900	624 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RTT107	YHR154W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
RTT107	YHR154W	YJU3	P28321	313 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RTT107	YHR154W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
RTT107	YHR154W	YDR090C	Q03193	310 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RTT107	YHR154W	MGE1	P38523	228 aa		2.78	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	OCA5	P38738	679 aa		2.78	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	FAR11	P53917	953 aa		2.78	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	SIS2	P36024	562 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	VAC8	P39968	578 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	MAD1	P40957	749 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	PEP7	P32609	515 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	SEC8	P32855	1065 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	CSE4	P36012	229 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	FPK1	P53739	893 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	SRF1	Q12516	437 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	YLR346C	Q06139	101 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	YOL098C	Q12496	1037 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	KEX2	P13134	814 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	ATE1	P16639	503 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	UBP1	P25037	809 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	CWC24	P53769	259 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	NIS1	P53939	407 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	CLB5	P30283	435 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	MET1	P36150	593 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	YPR109W	Q06104	294 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	TOM20	P35180	183 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	ACO2	P39533	789 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	OSW7	P43611	510 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	SLY41	P22215	453 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	YOR131C	Q12486	218 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	UGA3	P26370	528 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	ISF1	P32488	338 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	ORC6	P38826	435 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	HST2	P53686	357 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	OPT2	Q06593	877 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	UGA2	P38067	497 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	YPP1	P46951	817 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	DOS2	P54858	310 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	ERF2	Q06551	359 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	RGR1	P19263	1082 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	HPF1	Q05164	967 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	UBX5	Q06682	500 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	ENT1	Q12518	454 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	GAL2	P13181	574 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	RIM21	P48565	533 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	MRX10	Q05648	414 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	PUN1	Q06991	263 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	TBF1	Q02457	562 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	YBL086C	P38177	466 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RTT107	YHR154W	ATG36	P46983	293 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	ALD3	P54114	506 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.71	□□□□□ -1.98	not detected
RTT107	YHR154W	MOD5	P07884	428 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	SWE1	P32944	819 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	GRX7	P38068	203 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	YIR007W	P40566	764 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	PNP1	Q05788	311 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	WHI5	Q12416	295 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	MCM2	P29469	868 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	MDJ2	P42834	146 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	SCW11	P53189	542 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	GCN2	P15442	1659 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	ICP55	P40051	511 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	ALG12	P53730	551 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	MCM16	Q12262	181 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
RTT107	YHR154W	TUB4	P53378	473 aa		2.7	□□□□□ -1.98

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