RNA–Protein interactions for RNA: YHR071W

PCL5, Transcript of Cyclin, yeast

Gene PCL5, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PCL5	YHR071W	TRS33	Q99394	268 aa		5	□□□□□ -1.61
PCL5	YHR071W	HAT1	Q12341	374 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCL5	YHR071W	SRS2	P12954	1174 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL5	YHR071W	UBP1	P25037	809 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL5	YHR071W	CWH41	P53008	833 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL5	YHR071W	SLD2	P34252	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL5	YHR071W	KAR5	Q04746	504 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL5	YHR071W	PNP1	Q05788	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL5	YHR071W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	SUM1	P46676	1062 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	RRN6	P32786	894 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	SUV3	P32580	737 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	MCM1	P11746	286 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	ERP5	P38819	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	BOL3	P39724	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PCL5	YHR071W	LIP5	P32875	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	YKR073C	P36153	106 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	YBR197C	P38306	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	UBP5	P39944	805 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	BUD9	P53226	547 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	ISC10	P32645	267 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	SCD5	P34758	872 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	ATG1	P53104	897 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	MED7	Q08278	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	HXT5	P38695	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	QDR1	P40475	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	JJJ2	P46997	583 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	CAB1	Q04430	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	SEC20	P28791	383 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	ACF4	P47129	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	TRP3	P00937	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	IRE1	P32361	1115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	MRPL16	P38064	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	YTA6	P40328	754 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	MDJ2	P42834	146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	PSH1	Q12161	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	MRPL33	P20084	86 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	MLF3	P32047	452 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	YHL050C	P38721	697 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	YHR219W	P38900	624 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	SPR3	P41901	512 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	HEM3	P28789	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	CTH1	P47976	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	YNL165W	P53891	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PCL5	YHR071W	IPL1	P38991	367 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	APC11	Q12157	165 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	STB3	Q12427	513 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	AI3	P03877	415 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	VMA3	P25515	160 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	YCR015C	P25616	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	YKL222C	P35995	705 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	LDH1	P38139	375 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	TOS1	P38288	455 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	MSC7	P38694	644 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	PPX1	P38698	397 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	DYS1	P38791	387 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	QDR2	P40474	542 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	THI12	P42883	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	THI5	P43534	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	THI11	P47183	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	MTO1	P53070	669 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	NUT2	Q06213	157 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	THI13	Q07748	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	RPB10	P22139	70 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	RIP-Chip
PCL5	YHR071W	KAP122	P32767	1081 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	FIR1	P40020	876 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	HXT8	P40886	569 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	UFD2	P54860	961 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	NHA1	Q99271	985 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	ASF1	P32447	279 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PCL5	YHR071W	SMC1	P32908	1225 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.1 ms