RNA–Protein interactions for RNA: YHR003C

TCD1, Transcript of tRNA threonylcarbamoyladenosine dehydratase, yeast

Gene TCD1, Length 1,290 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TCD1	YHR003C	SWR1	Q05471	1514 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	RPC31	P17890	251 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	VMA3	P25515	160 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	ISC10	P32645	267 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	RRN6	P32786	894 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	DYS1	P38791	387 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	HEH2	Q03281	663 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	AI1	P03875	834 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	LDH1	P38139	375 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	MSC7	P38694	644 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	APM2	P38700	605 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	ICP55	P40051	511 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TCD1	YHR003C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	GEF1	P37020	779 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	ISW1	P38144	1129 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	GIP1	P38229	639 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	YBR287W	P38355	427 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	THI72	Q08579	599 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	APC11	Q12157	165 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	PHM7	Q12252	991 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	MET1	P36150	593 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	HXT8	P40886	569 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	YFL066C	P43538	392 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	YNR040W	P53736	256 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	NSG2	P53898	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	MSN1	P22148	382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
TCD1	YHR003C	MDJ1	P35191	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	BOL3	P39724	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	FIR1	P40020	876 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	PRK1	P40494	810 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	ITC1	P53125	1264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	BSD2	P38356	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	YNR014W	P53719	212 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	KAR5	Q04746	504 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	IDI1	P15496	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	SMC1	P32908	1225 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	BOI2	P39969	1040 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	MTC5	Q03897	1148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	RSC2	Q06488	889 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	KTR2	P33550	425 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	NTA1	P40354	457 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	YIL165C	P40446	119 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	TDA6	Q06466	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCD1	YHR003C	RPB10	P22139	70 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	AIM46	P38885	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	RAD55	P38953	406 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	QDR1	P40475	563 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	RGD2	P43556	714 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	ACF4	P47129	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	ATG1	P53104	897 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	ALG14	P38242	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	GIS4	Q04233	774 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	NHA1	Q99271	985 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	PPT1	P53043	513 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	UFD2	P54860	961 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	MRP10	O75012	95 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	PSY2	P40164	858 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	SLP1	Q12232	587 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	HAT1	Q12341	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	SKN7	P38889	622 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	ERP5	P38819	212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	YJL181W	P46987	611 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	TRS120	Q04183	1289 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TCD1	YHR003C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TCD1	YHR003C	MDJ2	P42834	146 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TCD1	YHR003C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TCD1	YHR003C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TCD1	YHR003C	RSC4	Q02206	625 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TCD1	YHR003C	YDR215C	Q12240	137 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TCD1	YHR003C	FUS1	P11710	512 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TCD1	YHR003C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TCD1	YHR003C	GIP2	P40036	548 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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