RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W JJJ2P46997 583 aa4.93□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W PEX21P50091 288 aa4.93□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W TPM1P17536 199 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W OPI1P21957 404 aa4.92□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W LCB1P25045 558 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W PES4P39684 611 aa4.92□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W IOC3P43596 787 aa4.92□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W ENP2P48234 707 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W ARG82P07250 355 aa4.92□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W HAL5P38970 855 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W RRI2Q12348 645 aa4.92□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W YLR278CQ05854 1341 aa4.91□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W SQS1P53866 767 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W IRC4Q03036 179 aa4.91□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W ILV3P39522 585 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W NOP2P40991 618 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W HXT10P43581 546 aa4.91□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W BDP1P46678 594 aa4.91□□□□□ -1.62
SPC105YGL093W CAF20P12962 161 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W RFC1P38630 861 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W APL6P46682 809 aa4.9□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W YJL171CP46992 396 aa4.9□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W NKP2Q06162 153 aa4.9□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W KTR1P27810 393 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W SLI15P38283 698 aa4.89□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W YGR117CP53270 476 aa4.89□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W YNL193WP53870 558 aa4.89□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W ALO1P54783 526 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W TOP1P04786 769 aa4.89□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W PCL8Q08966 492 aa4.89□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W TAH18Q12181 623 aa4.89□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W SNF3P10870 884 aa4.88□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W BOI1P38041 980 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W EPS1P40557 701 aa4.88□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W EMP47P43555 445 aa4.88□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W RPN7Q06103 429 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W KTR3P38130 404 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W FUN12P39730 1002 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W SET4P42948 560 aa4.88□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W BBC1P47068 1157 aa4.88□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W GAL2P13181 574 aa4.87□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W AFG2P32794 780 aa4.87□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W PBY1P38254 753 aa4.87□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W PIP2P52960 996 aa4.87□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W PUS6P53294 404 aa4.87□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W PUS5Q06244 254 aa4.87□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W IRC8P47046 822 aa4.87□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W KAR5Q04746 504 aa4.87□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W INM2Q05533 292 aa4.87□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W AI2P03876 854 aa4.87□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W PTK1P36002 662 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W MRPS35P53292 345 aa4.87□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data4.86□□□□□ -1.63not detected
SPC105YGL093W MET1P36150 593 aa4.86□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W UTP7P40055 554 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W PEA2P40091 420 aa4.86□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W FET4P40988 552 aa4.86□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W RRT6P53117 311 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W SNU71P53207 620 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W GCR2Q01722 534 aa4.86□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W GAS5Q08193 484 aa4.86□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W VAS1P07806 1104 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W STM1P39015 273 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W SPO22P40511 975 aa4.86□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W MPH3P0CE00 602 aa4.85□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W RTS1P38903 757 aa4.85□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W TRM44Q02648 567 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W RIM20Q12033 661 aa4.85□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W GRX7P38068 203 aa4.85□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W YIR014WP40570 242 aa4.85□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W MTC3P53077 123 aa4.85□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W THS1P04801 734 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W MDL2P33311 773 aa4.84□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data4.84□□□□□ -1.63not detected
SPC105YGL093W TOS4Q06266 489 aa4.84□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W FLO1P32768 1537 aa4.84□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W SEC20P28791 383 aa4.84□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W AAP1P37898 856 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W NIT1P40447 199 aa4.84□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W YPL260WQ08977 551 aa4.84□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W AIM7Q12156 149 aa4.84□□□□□ -1.63
SPC105YGL093W FLO11P08640 1367 aa4.84□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W KIN1P13185 1064 aa4.83□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W YIR042CP40586 236 aa4.83□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W CSR2Q12734 1121 aa4.83□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W LAM4P38800 1345 aa4.83□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W HPR1P17629 752 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W SSA4P22202 642 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W SLA1P32790 1244 aa4.83□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W BSD2P38356 321 aa4.83□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.2 ms