RNA–Protein interactions for RNA: YBR194W

AIM4, Transcript of Protein proposed to be associated with the nuclear pore complex, yeast

Gene AIM4, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM4	YBR194W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
AIM4	YBR194W	QDR2	P40474	542 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AIM4	YBR194W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
AIM4	YBR194W	PUN1	Q06991	263 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AIM4	YBR194W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
AIM4	YBR194W	YNR040W	P53736	256 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AIM4	YBR194W	HEH2	Q03281	663 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AIM4	YBR194W	PHM7	Q12252	991 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AIM4	YBR194W	ISC10	P32645	267 aa		5.08	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	APM2	P38700	605 aa		5.07	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	PRK1	P40494	810 aa		5.07	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	PNP1	Q05788	311 aa		5.07	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	THI72	Q08579	599 aa		5.07	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	KTR2	P33550	425 aa		5.06	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	ITC1	P53125	1264 aa		5.06	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	YOR296W	Q08748	1289 aa		5.06	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	APC11	Q12157	165 aa		5.06	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	LSO1	Q3E827	93 aa		5.06	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	DYS1	P38791	387 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	NSG2	P53898	299 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	MTC5	Q03897	1148 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	LDH1	P38139	375 aa		5.04	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	GIP1	P38229	639 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	BSD2	P38356	321 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AIM4	YBR194W	IDI1	P15496	288 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	MSN1	P22148	382 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	BOL3	P39724	118 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	TDA6	Q06466	467 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	SKN7	P38889	622 aa		5.01	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	MRP10	O75012	95 aa		5	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	RRN6	P32786	894 aa		5	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	MET1	P36150	593 aa		5	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	ISW1	P38144	1129 aa		5	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	BOI2	P39969	1040 aa		5	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	HXT8	P40886	569 aa		5	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	YIL165C	P40446	119 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	RGD2	P43556	714 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	GIS4	Q04233	774 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	RPB10	P22139	70 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	YNR014W	P53719	212 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	NTA1	P40354	457 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AIM4	YBR194W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	NHA1	Q99271	985 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	ALG14	P38242	237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	ATG1	P53104	897 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	RSC2	Q06488	889 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	SLP1	Q12232	587 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	SMC1	P32908	1225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	GEF1	P37020	779 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	YBR287W	P38355	427 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	AIM46	P38885	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	FIR1	P40020	876 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	PPT1	P53043	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	BUD9	P53226	547 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	KAR5	Q04746	504 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	RAD55	P38953	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	ACF4	P47129	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	SOG2	Q08817	791 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	TFA2	P36145	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	PSY2	P40164	858 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	QDR1	P40475	563 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	PRY1	P47032	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	ALD3	P54114	506 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	RSC4	Q02206	625 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	MNL2	Q12205	849 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM4	YBR194W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	AI3	P03877	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	GIP2	P40036	548 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	YJL181W	P46987	611 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM4	YBR194W	GUP1	P53154	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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