RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 NPHP3Q7Z494 1330 aa41.22■■■■■ 4.19
CAPNS1-217ENST00000629983 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ATRNO75882 1429 aa41.18■■■■■ 4.18
CAPNS1-217ENST00000629983 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
CAPNS1-217ENST00000629983 STK26Q9P289 416 aa41.14■■■■■ 4.18
CAPNS1-217ENST00000629983 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
CAPNS1-217ENST00000629983 MYOM2P54296 1465 aa41.14■■■■■ 4.18
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa41.13■■■■■ 4.18
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXO3O43524 673 aa41.13■■■■■ 4.17
CAPNS1-217ENST00000629983 NUTM2FA1L443 756 aa41.12■■■■■ 4.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PPLO60437 1756 aa41.11■■■■■ 4.17
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXD1Q16676 465 aa41.1■■■■■ 4.17
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa41.09■■■■■ 4.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PXDNQ92626 1479 aa41.09■■■■■ 4.17
CAPNS1-217ENST00000629983 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
CAPNS1-217ENST00000629983 RGL3Q3MIN7 710 aa41.06■■■■■ 4.16
CAPNS1-217ENST00000629983 WAPLQ7Z5K2 1190 aa41.06■■■■■ 4.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ZRANB1Q9UGI0 708 aa41.05■■■■■ 4.16
CAPNS1-217ENST00000629983 BCL9LQ86UU0 1499 aa41.02■■■■■ 4.16
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.02■■■■■ 4.16
CAPNS1-217ENST00000629983 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM132EQ6IEE7 984 aa40.97■■■■■ 4.15
CAPNS1-217ENST00000629983 TECPR2O15040 1411 aa40.95■■■■■ 4.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC125Q86Z20 511 aa40.95■■■■■ 4.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.95■■■■■ 4.15
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa40.95■■■■■ 4.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCC11Q96J66 1382 aa40.91■■■■■ 4.14
CAPNS1-217ENST00000629983 UNC5CLQ8IV45 518 aa40.9■■■■■ 4.14
CAPNS1-217ENST00000629983 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa40.89■■■■■ 4.14
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.88■■■■■ 4.13
CAPNS1-217ENST00000629983 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT28Q7Z3Y7 464 aa40.86■■■■■ 4.13
CAPNS1-217ENST00000629983 RALGAPBQ86X10 1494 aa40.84■■■■■ 4.13
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHG5O94827 1062 aa40.84■■■■■ 4.13
CAPNS1-217ENST00000629983 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa40.84■■■■■ 4.13
CAPNS1-217ENST00000629983 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
CAPNS1-217ENST00000629983 PIK3C2GO75747 1445 aa40.83■■■■■ 4.13
CAPNS1-217ENST00000629983 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.82■■■■■ 4.13
CAPNS1-217ENST00000629983 SLIT2O94813 1529 aa40.82■■■■■ 4.12
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF1AQ12756 1690 aa40.8■■■■■ 4.12
CAPNS1-217ENST00000629983 KNDC1Q76NI1 1749 aa40.8■■■■■ 4.12
CAPNS1-217ENST00000629983 FMN2Q9NZ56 1722 aa40.79■■■■■ 4.12
CAPNS1-217ENST00000629983 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
CAPNS1-217ENST00000629983 PHF8Q9UPP1 1060 aa40.77■■■■■ 4.12
CAPNS1-217ENST00000629983 PSME1Q06323 249 aa40.76■■■■■ 4.12
CAPNS1-217ENST00000629983 GLI3P10071 1580 aa40.76■■■■■ 4.12
CAPNS1-217ENST00000629983 EP400Q96L91 3159 aa40.76■■■■■ 4.11
CAPNS1-217ENST00000629983 IFT172Q9UG01 1749 aa40.76■■■■■ 4.11
CAPNS1-217ENST00000629983 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.11
CAPNS1-217ENST00000629983 LMOD2Q6P5Q4 547 aa40.75■■■■■ 4.11
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
CAPNS1-217ENST00000629983 TNS3Q68CZ2 1445 aa40.75■■■■■ 4.11
CAPNS1-217ENST00000629983 USP32Q8NFA0 1604 aa40.75■■■■■ 4.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
CAPNS1-217ENST00000629983 CABLES1Q8TDN4 633 aa40.73■■■■■ 4.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP40.71■■■■■ 4.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SEPT12Q8IYM1 358 aa40.71■■■■■ 4.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SIRT1Q96EB6 747 aa40.7■■■■■ 4.11
CAPNS1-217ENST00000629983 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
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CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB132Q7Z7B7 95 aa40.67■■■■■ 4.1
CAPNS1-217ENST00000629983 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.66■■■■■ 4.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAM1Q96QH2 718 aa40.64■■■■■ 4.1
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0G2JS52 829 aa40.63■■■■■ 4.09
CAPNS1-217ENST00000629983 MYT1Q01538 1121 aa40.63■■■■■ 4.09
CAPNS1-217ENST00000629983 SBNO1A3KN83 1393 aa40.62■■■■■ 4.09
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF10O15013 1369 aa40.61■■■■■ 4.09
CAPNS1-217ENST00000629983 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.6■■■■■ 4.09
CAPNS1-217ENST00000629983 POGKQ9P215 609 aa40.6■■■■■ 4.09
CAPNS1-217ENST00000629983 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa40.58■■■■■ 4.09
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT27Q7Z3Y8 459 aa40.57■■■■■ 4.09
CAPNS1-217ENST00000629983 BRWD3Q6RI45 1802 aa40.53■■■■■ 4.08
CAPNS1-217ENST00000629983 PLCH1Q4KWH8 1693 aa40.53■■■■■ 4.08
CAPNS1-217ENST00000629983 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
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CAPNS1-217ENST00000629983 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
CAPNS1-217ENST00000629983 NWD2Q9ULI1 1742 aa40.49■■■■■ 4.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKARQ7Z5J8 1434 aa40.49■■■■■ 4.07
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
CAPNS1-217ENST00000629983 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCA3Q99758 1704 aa40.45■■■■■ 4.07
CAPNS1-217ENST00000629983 BAG6P46379 1132 aa40.44■■■■■ 4.06
CAPNS1-217ENST00000629983 BTG4Q9NY30 223 aa40.44■■■■■ 4.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
CAPNS1-217ENST00000629983 DLC1Q96QB1 1528 aa40.43■■■■■ 4.06
CAPNS1-217ENST00000629983 GPRASP1Q5JY77 1395 aa40.43■■■■■ 4.06
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAK1Q9UPV9 953 aa40.42■■■■■ 4.06
CAPNS1-217ENST00000629983 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
CAPNS1-217ENST00000629983 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRB2O60241 1585 aa40.35■■■■■ 4.05
CAPNS1-217ENST00000629983 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
CAPNS1-217ENST00000629983 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.31■■■■■ 4.04
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR36Q9H6K5 1346 aa40.31■■■■■ 4.04
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRB1O14514 1584 aa40.3■■■■■ 4.04
CAPNS1-217ENST00000629983 NRAPQ86VF7 1730 aa40.3■■■■■ 4.04
CAPNS1-217ENST00000629983 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
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