RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623970.1

ARRDC1-AS1-203, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ARRDC1-AS1, Length 2,210 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.52■■■□□ 2.32
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ALKQ9UM73 1620 aa29.51■■■□□ 2.32
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ZNF521Q96K83 1311 aa29.51■■■□□ 2.31
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.5■■■□□ 2.31
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.48■■■□□ 2.31
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CABP2Q9NPB3 220 aa29.48■■■□□ 2.31
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.48■■■□□ 2.31
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 MLECQ14165 292 aa29.48■■■□□ 2.31
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.47■■■□□ 2.31
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 GOLGA2Q08379 1002 aa29.45■■■□□ 2.31
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.45■■■□□ 2.31
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NSD2O96028 1365 aa29.45■■■□□ 2.3
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PRAM1Q96QH2 718 aa29.44■■■□□ 2.3
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 POGKQ9P215 609 aa29.43■■■□□ 2.3
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.42■■■□□ 2.3
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NGEFQ8N5V2 710 aa29.41■■■□□ 2.3
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.41■■■□□ 2.3
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 APAF1O14727 1248 aa29.41■■■□□ 2.3
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SHPRHQ149N8 1683 aa29.41■■■□□ 2.3
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.41■■■□□ 2.3
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 EXOC6Q8TAG9 804 aa29.4■■■□□ 2.3
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.29
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SLFN5Q08AF3 891 aa29.37■■■□□ 2.29
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 A0A1W2PP64 1363 aa29.36■■■□□ 2.29
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ZMYM3Q14202 1370 aa29.36■■■□□ 2.29
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 DLC1Q96QB1 1528 aa29.35■■■□□ 2.29
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ABCC11Q96J66 1382 aa29.35■■■□□ 2.29
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 MTHFSP49914 203 aa29.33■■■□□ 2.29
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CFAP53Q96M91 514 aa29.33■■■□□ 2.29
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PLIN1O60240 522 aa29.32■■■□□ 2.28
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.32■■■□□ 2.28
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.3■■■□□ 2.28
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CDK19Q9BWU1 502 aa29.28■■■□□ 2.28
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.28■■■□□ 2.28
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 E9PSI1 815 aa29.28■■■□□ 2.28
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.26■■■□□ 2.27
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 RUNDC1Q96C34 613 aa29.26■■■□□ 2.27
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.25■■■□□ 2.27
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 MED14O60244 1454 aa29.24■■■□□ 2.27
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CRBNQ96SW2 442 aa29.23■■■□□ 2.27
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.23■■■□□ 2.27
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TNRQ92752 1358 aa29.23■■■□□ 2.27
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.22■■■□□ 2.27
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 WWC1Q8IX03 1113 aa29.21■■■□□ 2.27
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.21■■■□□ 2.27
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.2■■■□□ 2.26
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NLRP1Q9C000 1473 aa29.2■■■□□ 2.26
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 FYB1O15117 783 aa29.19■■■□□ 2.26
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CABP1Q9NZU7 370 aa29.18■■■□□ 2.26
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.17■■■□□ 2.26
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.17■■■□□ 2.26
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 C20orf194Q5TEA3 1177 aa29.17■■■□□ 2.26
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 METP08581 1390 aa29.16■■■□□ 2.26
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.16■■■□□ 2.26
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.15■■■□□ 2.26
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ATP7BP35670 1465 aa29.15■■■□□ 2.26
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.14■■■□□ 2.26
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.13■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.12■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CCDC27Q2M243 656 aa29.12■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NEUROD2Q15784 382 aa29.11■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SIRT1Q96EB6 747 aa29.1■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TECPR2O15040 1411 aa29.1■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.1■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 WDR63Q8IWG1 891 aa29.1■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ADGRB2O60241 1585 aa29.09■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CPS1P31327 1500 aa29.07■■■□□ 2.24
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.06■■■□□ 2.24
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 BCAR3O75815 825 aa29.04■■■□□ 2.24
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.02■■■□□ 2.24
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.02■■■□□ 2.24
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PLEKHF1Q96S99 279 aa29■■■□□ 2.23
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 MSH5O43196 834 aa28.99■■■□□ 2.23
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.99■■■□□ 2.23
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.98■■■□□ 2.23
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms