RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614927.1

NPIPB11-202, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B11, humanhuman

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Gene NPIPB11, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11-202ENST00000614927 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
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NPIPB11-202ENST00000614927 CCDC7Q96M83 1385 aa20.46■□□□□ 0.87
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NPIPB11-202ENST00000614927 USP32Q8NFA0 1604 aa20.4■□□□□ 0.86
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NPIPB11-202ENST00000614927 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.37■□□□□ 0.85
NPIPB11-202ENST00000614927 PANK3Q9H999 370 aa20.36■□□□□ 0.85
NPIPB11-202ENST00000614927 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.35■□□□□ 0.85
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NPIPB11-202ENST00000614927 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NPIPB11-202ENST00000614927 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.34■□□□□ 0.85
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
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NPIPB11-202ENST00000614927 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.32■□□□□ 0.84
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NPIPB11-202ENST00000614927 A0A1W2PP64 1363 aa20.32■□□□□ 0.84
NPIPB11-202ENST00000614927 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
NPIPB11-202ENST00000614927 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.31■□□□□ 0.84
NPIPB11-202ENST00000614927 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.31■□□□□ 0.84
NPIPB11-202ENST00000614927 ITSN1Q15811 1721 aa20.3■□□□□ 0.84
NPIPB11-202ENST00000614927 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.3■□□□□ 0.84
NPIPB11-202ENST00000614927 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
NPIPB11-202ENST00000614927 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.29■□□□□ 0.84
NPIPB11-202ENST00000614927 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
NPIPB11-202ENST00000614927 CARD14Q9BXL6 1004 aa20.29■□□□□ 0.84
NPIPB11-202ENST00000614927 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.29■□□□□ 0.84
NPIPB11-202ENST00000614927 KIF1AQ12756 1690 aa20.27■□□□□ 0.84
NPIPB11-202ENST00000614927 USP6P35125 1406 aa20.27■□□□□ 0.83
NPIPB11-202ENST00000614927 MYOM1P52179 1685 aa20.26■□□□□ 0.83
NPIPB11-202ENST00000614927 PLEKHG5O94827 1062 aa20.26■□□□□ 0.83
NPIPB11-202ENST00000614927 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
NPIPB11-202ENST00000614927 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.26■□□□□ 0.83
NPIPB11-202ENST00000614927 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.25■□□□□ 0.83
NPIPB11-202ENST00000614927 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
NPIPB11-202ENST00000614927 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.25■□□□□ 0.83
NPIPB11-202ENST00000614927 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.24■□□□□ 0.83
NPIPB11-202ENST00000614927 FBXO41Q8TF61 875 aa20.24■□□□□ 0.83
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