RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596573.5

PCBP1-AS1-249, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 774 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa8.72□□□□□ -1.01
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 FAM161AQ3B820 660 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 FCHSD2O94868 740 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 FUT2Q10981 343 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 BRICD5Q6PL45 260 aa8.69□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 RDH13Q8NBN7 331 aa8.69□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 NUTM2FA1L443 756 aa8.68□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 MMP16P51512 607 aa8.67□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 WNT7BP56706 349 aa8.67□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 KCNMA1Q12791 1236 aa8.66□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.66□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 Q3C1V9 767 aa8.65□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 FECHP22830 423 aa8.64□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 SULF1Q8IWU6 871 aa8.64□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 ERBB4Q15303 1308 aa8.62□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 GCGRP47871 477 aa8.62□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 VSIG8P0DPA2 414 aa8.61□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.61□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.6□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 ALDH1A1P00352 501 aa8.6□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 HIC1Q14526 733 aa8.6□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.6□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 BMP1P13497 986 aa8.59□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 VEGFBP49765 207 aa8.59□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.58□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 SKOR1P84550 965 aa8.56□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.56□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.55□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 GSK3AP49840 483 aa8.53□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.52□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 GDF11O95390 407 aa8.51□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.51□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 ZFP42Q96MM3 310 aa8.51□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 SIAH2O43255 324 aa8.5□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 SCARF1Q14162 830 aa8.49□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.49□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 GNPATO15228 680 aa8.48□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 RASSF7Q02833 373 aa8.48□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 IGHA1P01876 353 aa8.47□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 ABCC9O60706 1549 aa8.46□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 CFAP44Q96MT7 982 aa8.46□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 JUNDP17535 347 aa8.45□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 USP46P62068 366 aa8.45□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 P3H3Q8IVL6 736 aa8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 KDM4AO75164 1064 aa8.42□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 FOXK2Q01167 660 aa8.42□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 MPNDQ8N594 471 aa8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 ADH1CP00326 375 aa8.4□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 CD46P15529 392 aa8.4□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 NLRP7Q8WX94 980 aa8.4□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 NNTQ13423 1086 aa8.38□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 MAN1A2O60476 641 aa8.37□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 TIMP2P16035 220 aa8.37□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 SH3BP2P78314 561 aa8.37□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.37□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 GPR37O15354 613 aa8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 PPFIA3O75145 1194 aa8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 PHOX2BQ99453 314 aa8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 HOXA2O43364 376 aa8.35□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 XP32Q5T750 250 aa8.35□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 KANK3Q6NY19 840 aa8.35□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 RETREG3Q86VR2 466 aa8.35□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 SOBPA7XYQ1 873 aa8.34□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 SEMA3EO15041 775 aa8.34□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 MS4A1P11836 297 aa8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 UPP2O95045 317 aa8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 PTPRNQ16849 979 aa8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 SVOPQ8N4V2 548 aa8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 HLA-CQ95604 372 aa8.29□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 KRT76Q01546 638 aa8.28□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-249ENST00000596573 ZNF511Q8NB15 262 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms