RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589649.1

TOMM40-205, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

TSL 2

Gene TOMM40, Length 731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-205ENST00000589649 ABCC11Q96J66 1382 aa36.17■■■■□ 3.38
TOMM40-205ENST00000589649 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
TOMM40-205ENST00000589649 TECPR2O15040 1411 aa36.17■■■■□ 3.38
TOMM40-205ENST00000589649 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
TOMM40-205ENST00000589649 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.13■■■■□ 3.37
TOMM40-205ENST00000589649 NUTM2FA1L443 756 aa36.13■■■■□ 3.37
TOMM40-205ENST00000589649 PNPLA6Q8IY17 1366 aa36.12■■■■□ 3.37
TOMM40-205ENST00000589649 HRCP23327 699 aa36.11■■■■□ 3.37
TOMM40-205ENST00000589649 MYOM2P54296 1465 aa36.11■■■■□ 3.37
TOMM40-205ENST00000589649 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.1■■■■□ 3.37
TOMM40-205ENST00000589649 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.09■■■■□ 3.37
TOMM40-205ENST00000589649 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
TOMM40-205ENST00000589649 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.06■■■■□ 3.36
TOMM40-205ENST00000589649 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.06■■■■□ 3.36
TOMM40-205ENST00000589649 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
TOMM40-205ENST00000589649 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
TOMM40-205ENST00000589649 LAMC1P11047 1609 aa36.03■■■■□ 3.36
TOMM40-205ENST00000589649 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.02■■■■□ 3.36
TOMM40-205ENST00000589649 SIRT1Q96EB6 747 aa36.01■■■■□ 3.36
TOMM40-205ENST00000589649 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
TOMM40-205ENST00000589649 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36■■■■□ 3.35
TOMM40-205ENST00000589649 FOXO3O43524 673 aa35.99■■■■□ 3.35
TOMM40-205ENST00000589649 AFF2P51816 1311 aa35.99■■■■□ 3.35
TOMM40-205ENST00000589649 C8orf37Q96NL8 207 aa35.98■■■■□ 3.35
TOMM40-205ENST00000589649 ADAMTS2O95450 1211 aa35.97■■■■□ 3.35
TOMM40-205ENST00000589649 PRAM1Q96QH2 718 aa35.97■■■■□ 3.35
TOMM40-205ENST00000589649 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.95■■■■□ 3.35
TOMM40-205ENST00000589649 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.91■■■■□ 3.34
TOMM40-205ENST00000589649 PXDNQ92626 1479 aa35.91■■■■□ 3.34
TOMM40-205ENST00000589649 POGKQ9P215 609 aa35.9■■■■□ 3.34
TOMM40-205ENST00000589649 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.9■■■■□ 3.34
TOMM40-205ENST00000589649 ADGRB1O14514 1584 aa35.89■■■■□ 3.34
TOMM40-205ENST00000589649 RXRBP28702 533 aa35.88■■■■□ 3.33
TOMM40-205ENST00000589649 NGLY1Q96IV0 654 aa35.87■■■■□ 3.33
TOMM40-205ENST00000589649 DLC1Q96QB1 1528 aa35.83■■■■□ 3.33
TOMM40-205ENST00000589649 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
TOMM40-205ENST00000589649 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
TOMM40-205ENST00000589649 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.8■■■■□ 3.32
TOMM40-205ENST00000589649 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.79■■■■□ 3.32
TOMM40-205ENST00000589649 STAC3Q96MF2 364 aa35.79■■■■□ 3.32
TOMM40-205ENST00000589649 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
TOMM40-205ENST00000589649 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
TOMM40-205ENST00000589649 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
TOMM40-205ENST00000589649 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.75■■■■□ 3.31
TOMM40-205ENST00000589649 USP21Q9UK80 565 aa35.74■■■■□ 3.31
TOMM40-205ENST00000589649 KIF1AQ12756 1690 aa35.74■■■■□ 3.31
TOMM40-205ENST00000589649 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.73■■■■□ 3.31
TOMM40-205ENST00000589649 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
TOMM40-205ENST00000589649 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
TOMM40-205ENST00000589649 USP32Q8NFA0 1604 aa35.68■■■■□ 3.3
TOMM40-205ENST00000589649 PLEKHG5O94827 1062 aa35.68■■■■□ 3.3
TOMM40-205ENST00000589649 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
TOMM40-205ENST00000589649 ADGRB2O60241 1585 aa35.67■■■■□ 3.3
TOMM40-205ENST00000589649 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.66■■■■□ 3.3
TOMM40-205ENST00000589649 PSME1Q06323 249 aa35.66■■■■□ 3.3
TOMM40-205ENST00000589649 RGS12O14924 1447 aa35.66■■■■□ 3.3
TOMM40-205ENST00000589649 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.66■■■■□ 3.3
TOMM40-205ENST00000589649 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
TOMM40-205ENST00000589649 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP35.64■■■■□ 3.38e-7■■□□□ 14.2
TOMM40-205ENST00000589649 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
TOMM40-205ENST00000589649 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.62■■■■□ 3.29
TOMM40-205ENST00000589649 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.62■■■■□ 3.29
TOMM40-205ENST00000589649 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.62■■■■□ 3.29
TOMM40-205ENST00000589649 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.62■■■■□ 3.29
TOMM40-205ENST00000589649 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
TOMM40-205ENST00000589649 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.58■■■■□ 3.29
TOMM40-205ENST00000589649 SBNO1A3KN83 1393 aa35.58■■■■□ 3.29
TOMM40-205ENST00000589649 BCL9LQ86UU0 1499 aa35.58■■■■□ 3.29
TOMM40-205ENST00000589649 ATRNO75882 1429 aa35.57■■■■□ 3.29
TOMM40-205ENST00000589649 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.57■■■■□ 3.28
TOMM40-205ENST00000589649 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
TOMM40-205ENST00000589649 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
TOMM40-205ENST00000589649 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
TOMM40-205ENST00000589649 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.52■■■■□ 3.28
TOMM40-205ENST00000589649 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
TOMM40-205ENST00000589649 CDK19Q9BWU1 502 aa35.5■■■■□ 3.27
TOMM40-205ENST00000589649 NEUROD1Q13562 356 aa35.49■■■■□ 3.27
TOMM40-205ENST00000589649 ARHGEF10O15013 1369 aa35.49■■■■□ 3.27
TOMM40-205ENST00000589649 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.49■■■■□ 3.27
TOMM40-205ENST00000589649 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
TOMM40-205ENST00000589649 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.48■■■■□ 3.27
TOMM40-205ENST00000589649 UNC5CLQ8IV45 518 aa35.46■■■■□ 3.27
TOMM40-205ENST00000589649 SLIT2O94813 1529 aa35.46■■■■□ 3.27
TOMM40-205ENST00000589649 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
TOMM40-205ENST00000589649 ATP7BP35670 1465 aa35.44■■■■□ 3.26
TOMM40-205ENST00000589649 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
TOMM40-205ENST00000589649 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
TOMM40-205ENST00000589649 FAM83GA6ND36 823 aa35.39■■■■□ 3.26
TOMM40-205ENST00000589649 ABCA3Q99758 1704 aa35.38■■■■□ 3.25
TOMM40-205ENST00000589649 ALS2Q96Q42 1657 aa35.36■■■■□ 3.25
TOMM40-205ENST00000589649 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.35■■■■□ 3.25
TOMM40-205ENST00000589649 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
TOMM40-205ENST00000589649 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
TOMM40-205ENST00000589649 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.33■■■■□ 3.25
TOMM40-205ENST00000589649 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.33■■■■□ 3.25
TOMM40-205ENST00000589649 GLI3P10071 1580 aa35.33■■■■□ 3.25
TOMM40-205ENST00000589649 ACEP12821 1306 aa35.32■■■■□ 3.24
TOMM40-205ENST00000589649 ITSN1Q15811 1721 aa35.31■■■■□ 3.24
TOMM40-205ENST00000589649 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
TOMM40-205ENST00000589649 VPS72Q15906 364 aa35.3■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.3 ms