RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589452.1

PQLC1-210, Transcript of PQ loop repeat containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PQLC1, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1-210ENST00000589452 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa42.36■■■■■ 4.37
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PQLC1-210ENST00000589452 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
PQLC1-210ENST00000589452 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
PQLC1-210ENST00000589452 KNDC1Q76NI1 1749 aa42.33■■■■■ 4.37
PQLC1-210ENST00000589452 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
PQLC1-210ENST00000589452 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
PQLC1-210ENST00000589452 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
PQLC1-210ENST00000589452 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa42.29■■■■■ 4.36
PQLC1-210ENST00000589452 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa42.29■■■■■ 4.36
PQLC1-210ENST00000589452 NUTM2FA1L443 756 aa42.26■■■■■ 4.36
PQLC1-210ENST00000589452 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.35
PQLC1-210ENST00000589452 DCAF11Q8TEB1 546 aa42.25■■■■■ 4.35
PQLC1-210ENST00000589452 LAMC1P11047 1609 aa42.24■■■■■ 4.35
PQLC1-210ENST00000589452 ESCO1Q5FWF5 840 aa42.23■■■■■ 4.35
PQLC1-210ENST00000589452 PNPLA6Q8IY17 1366 aa42.22■■■■■ 4.35
PQLC1-210ENST00000589452 SIRT1Q96EB6 747 aa42.21■■■■■ 4.35
PQLC1-210ENST00000589452 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
PQLC1-210ENST00000589452 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP42.14■■■■■ 4.34
PQLC1-210ENST00000589452 PRAM1Q96QH2 718 aa42.13■■■■■ 4.33
PQLC1-210ENST00000589452 FMN2Q9NZ56 1722 aa42.11■■■■■ 4.33
PQLC1-210ENST00000589452 FOXO3O43524 673 aa42.1■■■■■ 4.33
PQLC1-210ENST00000589452 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
PQLC1-210ENST00000589452 ADGRB1O14514 1584 aa42.1■■■■■ 4.33
PQLC1-210ENST00000589452 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP42.09■■■■■ 4.33
PQLC1-210ENST00000589452 NPHP3Q7Z494 1330 aa42.08■■■■■ 4.33
PQLC1-210ENST00000589452 POGKQ9P215 609 aa42.07■■■■■ 4.33
PQLC1-210ENST00000589452 TRAK1Q9UPV9 953 aa42.07■■■■■ 4.33
PQLC1-210ENST00000589452 STAC3Q96MF2 364 aa42.05■■■■■ 4.32
PQLC1-210ENST00000589452 DLC1Q96QB1 1528 aa42.05■■■■■ 4.32
PQLC1-210ENST00000589452 AFF2P51816 1311 aa42.03■■■■■ 4.32
PQLC1-210ENST00000589452 C8orf37Q96NL8 207 aa42.02■■■■■ 4.32
PQLC1-210ENST00000589452 PXDNQ92626 1479 aa42.02■■■■■ 4.32
PQLC1-210ENST00000589452 ADAMTS2O95450 1211 aa42.01■■■■■ 4.32
PQLC1-210ENST00000589452 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
PQLC1-210ENST00000589452 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
PQLC1-210ENST00000589452 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
PQLC1-210ENST00000589452 KIF1AQ12756 1690 aa41.91■■■■■ 4.3
PQLC1-210ENST00000589452 NGLY1Q96IV0 654 aa41.91■■■■■ 4.3
PQLC1-210ENST00000589452 PHF8Q9UPP1 1060 aa41.91■■■■■ 4.3
PQLC1-210ENST00000589452 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
PQLC1-210ENST00000589452 RXRBP28702 533 aa41.89■■■■■ 4.3
PQLC1-210ENST00000589452 KRT28Q7Z3Y7 464 aa41.88■■■■■ 4.29
PQLC1-210ENST00000589452 ADGRB2O60241 1585 aa41.84■■■■■ 4.29
PQLC1-210ENST00000589452 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
PQLC1-210ENST00000589452 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa41.83■■■■■ 4.29
PQLC1-210ENST00000589452 USP32Q8NFA0 1604 aa41.83■■■■■ 4.29
PQLC1-210ENST00000589452 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa41.81■■■■■ 4.28
PQLC1-210ENST00000589452 ANKARQ7Z5J8 1434 aa41.79■■■■■ 4.28
PQLC1-210ENST00000589452 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
PQLC1-210ENST00000589452 WASLO00401 505 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
PQLC1-210ENST00000589452 NBPF1Q3BBV0 1214 aa41.76■■■■■ 4.28
PQLC1-210ENST00000589452 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.76■■■■■ 4.28
PQLC1-210ENST00000589452 PRR36Q9H6K5 1346 aa41.75■■■■■ 4.27
PQLC1-210ENST00000589452 PSME1Q06323 249 aa41.75■■■■■ 4.27
PQLC1-210ENST00000589452 USP21Q9UK80 565 aa41.75■■■■■ 4.27
PQLC1-210ENST00000589452 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa41.72■■■■■ 4.27
PQLC1-210ENST00000589452 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
PQLC1-210ENST00000589452 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
PQLC1-210ENST00000589452 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.7■■■■■ 4.27
PQLC1-210ENST00000589452 TNS3Q68CZ2 1445 aa41.69■■■■■ 4.27
PQLC1-210ENST00000589452 TULP4Q9NRJ4 1543 aa41.69■■■■■ 4.27
PQLC1-210ENST00000589452 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
PQLC1-210ENST00000589452 PLEKHG5O94827 1062 aa41.69■■■■■ 4.26
PQLC1-210ENST00000589452 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
PQLC1-210ENST00000589452 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
PQLC1-210ENST00000589452 NEUROD1Q13562 356 aa41.67■■■■■ 4.26
PQLC1-210ENST00000589452 LMOD2Q6P5Q4 547 aa41.67■■■■■ 4.26
PQLC1-210ENST00000589452 SBNO1A3KN83 1393 aa41.66■■■■■ 4.26
PQLC1-210ENST00000589452 CABLES1Q8TDN4 633 aa41.65■■■■■ 4.26
PQLC1-210ENST00000589452 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
PQLC1-210ENST00000589452 RGS12O14924 1447 aa41.61■■■■■ 4.25
PQLC1-210ENST00000589452 CDK19Q9BWU1 502 aa41.59■■■■■ 4.25
PQLC1-210ENST00000589452 ATRNO75882 1429 aa41.59■■■■■ 4.25
PQLC1-210ENST00000589452 BCL9LQ86UU0 1499 aa41.59■■■■■ 4.25
PQLC1-210ENST00000589452 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
PQLC1-210ENST00000589452 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
PQLC1-210ENST00000589452 GPRASP1Q5JY77 1395 aa41.56■■■■■ 4.24
PQLC1-210ENST00000589452 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
PQLC1-210ENST00000589452 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP41.56■■■■■ 4.247e-7■■■■□ 19.3
PQLC1-210ENST00000589452 ARHGEF10O15013 1369 aa41.55■■■■■ 4.24
PQLC1-210ENST00000589452 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
PQLC1-210ENST00000589452 ATP7BP35670 1465 aa41.53■■■■■ 4.24
PQLC1-210ENST00000589452 ABCA3Q99758 1704 aa41.48■■■■■ 4.23
PQLC1-210ENST00000589452 SLIT2O94813 1529 aa41.48■■■■■ 4.23
PQLC1-210ENST00000589452 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
PQLC1-210ENST00000589452 ITSN1Q15811 1721 aa41.47■■■■■ 4.23
PQLC1-210ENST00000589452 UNC5CLQ8IV45 518 aa41.46■■■■■ 4.23
PQLC1-210ENST00000589452 ALS2Q96Q42 1657 aa41.45■■■■■ 4.23
PQLC1-210ENST00000589452 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
PQLC1-210ENST00000589452 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
PQLC1-210ENST00000589452 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa41.42■■■■■ 4.22
PQLC1-210ENST00000589452 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
PQLC1-210ENST00000589452 CCDC61Q9Y6R9 512 aa41.41■■■■■ 4.22
PQLC1-210ENST00000589452 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
PQLC1-210ENST00000589452 FAM83GA6ND36 823 aa41.38■■■■■ 4.21
PQLC1-210ENST00000589452 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa41.38■■■■■ 4.21
PQLC1-210ENST00000589452 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
PQLC1-210ENST00000589452 ACEP12821 1306 aa41.37■■■■■ 4.21
PQLC1-210ENST00000589452 QRICH2Q9H0J4 1663 aa41.36■■■■■ 4.21
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