RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 PIK3C2GO75747 1445 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-210ENST00000588340 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-210ENST00000588340 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa10.08□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 TECPR2O15040 1411 aa10.08□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM132EQ6IEE7 984 aa10.08□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 C1orf167Q5SNV9 1468 aa10.08□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 LAMC1P11047 1609 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 MYOM2P54296 1465 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 ABCC11Q96J66 1382 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 STK26Q9P289 416 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 LRP6O75581 1613 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 POTEAQ6S8J7 498 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 WAPLQ7Z5K2 1190 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 ORAI2Q96SN7 254 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 CFAP70Q5T0N1 1121 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 FMN2Q9NZ56 1722 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 SIRT1Q96EB6 747 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 PNPLA6Q8IY17 1366 aa10.02□□□□□ -0.8
EFTUD2-210ENST00000588340 ESCO1Q5FWF5 840 aa10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 DCAF11Q8TEB1 546 aa10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 CHRDL2Q6WN34 429 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 STAC3Q96MF2 364 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 ADGRB1O14514 1584 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 NUTM2FA1L443 756 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 DLC1Q96QB1 1528 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 KIF1AQ12756 1690 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 FOXO3O43524 673 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 PRAM1Q96QH2 718 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 NPHP3Q7Z494 1330 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 PXDNQ92626 1479 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 CLSPNQ9HAW4 1339 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 POGKQ9P215 609 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 AFF2P51816 1311 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 ADGRB2O60241 1585 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 USP32Q8NFA0 1604 aa9.96□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa9.96□□□□□ -0.81
EFTUD2-210ENST00000588340 ADAMTS2O95450 1211 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 C8orf37Q96NL8 207 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 RXRBP28702 533 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 NGLY1Q96IV0 654 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 KRT28Q7Z3Y7 464 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 PCGF6Q9BYE7 350 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 PSME1Q06323 249 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 ITSN1Q15811 1721 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 USP21Q9UK80 565 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 ABCA3Q99758 1704 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-210ENST00000588340 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
EFTUD2-210ENST00000588340 TNS3Q68CZ2 1445 aa9.9□□□□□ -0.83
EFTUD2-210ENST00000588340 SBNO1A3KN83 1393 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-210ENST00000588340 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-210ENST00000588340 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-210ENST00000588340 ALS2Q96Q42 1657 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-210ENST00000588340 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-210ENST00000588340 BCL9LQ86UU0 1499 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-210ENST00000588340 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-210ENST00000588340 RGS12O14924 1447 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-210ENST00000588340 ATRNO75882 1429 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-210ENST00000588340 ARHGEF10O15013 1369 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-210ENST00000588340 ATP7BP35670 1465 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-210ENST00000588340 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.3 ms