RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583826.5

TSPOAP1-AS1-209, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,004 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.8■■■■■ 4.28
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 KNDC1Q76NI1 1749 aa41.76■■■■■ 4.28
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 NPHP3Q7Z494 1330 aa41.67■■■■■ 4.26
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP41.46■■■■■ 4.23
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PRAM1Q96QH2 718 aa41.46■■■■■ 4.23
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.41■■■■■ 4.22
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 DLC1Q96QB1 1528 aa41.4■■■■■ 4.22
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.39■■■■■ 4.22
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TRAK1Q9UPV9 953 aa41.33■■■■■ 4.21
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 STAC3Q96MF2 364 aa41.27■■■■■ 4.2
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CDK19Q9BWU1 502 aa40.87■■■■■ 4.13
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 BRWD3Q6RI45 1802 aa40.83■■■■■ 4.13
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SEPT12Q8IYM1 358 aa40.82■■■■■ 4.13
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