RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568485.1

E2F4-210, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 707 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-210ENST00000568485 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa33■■■□□ 2.87
E2F4-210ENST00000568485 RGL3Q3MIN7 710 aa32.99■■■□□ 2.87
E2F4-210ENST00000568485 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
E2F4-210ENST00000568485 RGS12O14924 1447 aa32.97■■■□□ 2.87
E2F4-210ENST00000568485 ADAMTS2O95450 1211 aa32.97■■■□□ 2.87
E2F4-210ENST00000568485 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
E2F4-210ENST00000568485 PIK3C2GO75747 1445 aa32.96■■■□□ 2.87
E2F4-210ENST00000568485 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
E2F4-210ENST00000568485 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.86
E2F4-210ENST00000568485 ABCC11Q96J66 1382 aa32.94■■■□□ 2.86
E2F4-210ENST00000568485 NGLY1Q96IV0 654 aa32.93■■■□□ 2.86
E2F4-210ENST00000568485 PXDNQ92626 1479 aa32.93■■■□□ 2.86
E2F4-210ENST00000568485 KNDC1Q76NI1 1749 aa32.92■■■□□ 2.86
E2F4-210ENST00000568485 ESCO1Q5FWF5 840 aa32.92■■■□□ 2.86
E2F4-210ENST00000568485 WAPLQ7Z5K2 1190 aa32.92■■■□□ 2.86
E2F4-210ENST00000568485 STK26Q9P289 416 aa32.92■■■□□ 2.86
E2F4-210ENST00000568485 NPHP3Q7Z494 1330 aa32.92■■■□□ 2.86
E2F4-210ENST00000568485 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa32.9■■■□□ 2.86
E2F4-210ENST00000568485 MYOM2P54296 1465 aa32.9■■■□□ 2.86
E2F4-210ENST00000568485 TMEM132EQ6IEE7 984 aa32.89■■■□□ 2.86
E2F4-210ENST00000568485 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP32.86■■■□□ 2.85
E2F4-210ENST00000568485 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
E2F4-210ENST00000568485 USP21Q9UK80 565 aa32.85■■■□□ 2.85
E2F4-210ENST00000568485 FOXO3O43524 673 aa32.84■■■□□ 2.85
E2F4-210ENST00000568485 NRXN1Q9ULB1 1477 aa32.83■■■□□ 2.85
E2F4-210ENST00000568485 NUTM2FA1L443 756 aa32.82■■■□□ 2.84
E2F4-210ENST00000568485 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
E2F4-210ENST00000568485 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
E2F4-210ENST00000568485 FMN2Q9NZ56 1722 aa32.81■■■□□ 2.84
E2F4-210ENST00000568485 ATRNO75882 1429 aa32.8■■■□□ 2.84
E2F4-210ENST00000568485 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP32.8■■■□□ 2.84
E2F4-210ENST00000568485 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
E2F4-210ENST00000568485 SIRT1Q96EB6 747 aa32.78■■■□□ 2.84
E2F4-210ENST00000568485 KIF1AQ12756 1690 aa32.75■■■□□ 2.83
E2F4-210ENST00000568485 BCL9LQ86UU0 1499 aa32.74■■■□□ 2.83
E2F4-210ENST00000568485 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
E2F4-210ENST00000568485 CFAP70Q5T0N1 1121 aa32.72■■■□□ 2.83
E2F4-210ENST00000568485 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa32.7■■■□□ 2.82
E2F4-210ENST00000568485 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.82
E2F4-210ENST00000568485 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa32.7■■■□□ 2.82
E2F4-210ENST00000568485 ATAD2Q6PL18 1390 aa32.69■■■□□ 2.82
E2F4-210ENST00000568485 KRT28Q7Z3Y7 464 aa32.64■■■□□ 2.82
E2F4-210ENST00000568485 DLC1Q96QB1 1528 aa32.64■■■□□ 2.82
E2F4-210ENST00000568485 SLIT2O94813 1529 aa32.62■■■□□ 2.81
E2F4-210ENST00000568485 PRAM1Q96QH2 718 aa32.62■■■□□ 2.81
E2F4-210ENST00000568485 PHF8Q9UPP1 1060 aa32.62■■■□□ 2.81
E2F4-210ENST00000568485 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
E2F4-210ENST00000568485 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP32.61■■■□□ 2.81
E2F4-210ENST00000568485 ADGRB1O14514 1584 aa32.61■■■□□ 2.81
E2F4-210ENST00000568485 TNS3Q68CZ2 1445 aa32.6■■■□□ 2.81
E2F4-210ENST00000568485 USP32Q8NFA0 1604 aa32.6■■■□□ 2.81
E2F4-210ENST00000568485 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
E2F4-210ENST00000568485 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP32.58■■■□□ 2.81
E2F4-210ENST00000568485 ADGRB2O60241 1585 aa32.57■■■□□ 2.8
E2F4-210ENST00000568485 UNC5CLQ8IV45 518 aa32.56■■■□□ 2.8
E2F4-210ENST00000568485 SBNO1A3KN83 1393 aa32.56■■■□□ 2.8
E2F4-210ENST00000568485 ANKARQ7Z5J8 1434 aa32.55■■■□□ 2.8
E2F4-210ENST00000568485 GLI3P10071 1580 aa32.54■■■□□ 2.8
E2F4-210ENST00000568485 RALGAPBQ86X10 1494 aa32.54■■■□□ 2.8
E2F4-210ENST00000568485 PSME1Q06323 249 aa32.53■■■□□ 2.8
E2F4-210ENST00000568485 POGKQ9P215 609 aa32.52■■■□□ 2.8
E2F4-210ENST00000568485 CABLES1Q8TDN4 633 aa32.49■■■□□ 2.79
E2F4-210ENST00000568485 ABCA3Q99758 1704 aa32.48■■■□□ 2.79
E2F4-210ENST00000568485 ARHGEF10O15013 1369 aa32.47■■■□□ 2.79
E2F4-210ENST00000568485 TRAK1Q9UPV9 953 aa32.47■■■□□ 2.79
E2F4-210ENST00000568485 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa32.46■■■□□ 2.79
E2F4-210ENST00000568485 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
E2F4-210ENST00000568485 PLCH1Q4KWH8 1693 aa32.43■■■□□ 2.78
E2F4-210ENST00000568485 CCDC125Q86Z20 511 aa32.43■■■□□ 2.78
E2F4-210ENST00000568485 DCAF11Q8TEB1 546 aa32.43■■■□□ 2.78
E2F4-210ENST00000568485 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
E2F4-210ENST00000568485 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa32.43■■■□□ 2.78
E2F4-210ENST00000568485 PRR36Q9H6K5 1346 aa32.43■■■□□ 2.78
E2F4-210ENST00000568485 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
E2F4-210ENST00000568485 NWD2Q9ULI1 1742 aa32.42■■■□□ 2.78
E2F4-210ENST00000568485 TULP4Q9NRJ4 1543 aa32.41■■■□□ 2.78
E2F4-210ENST00000568485 VPS72Q15906 364 aa32.41■■■□□ 2.78
E2F4-210ENST00000568485 LMOD2Q6P5Q4 547 aa32.41■■■□□ 2.78
E2F4-210ENST00000568485 PLEKHG5O94827 1062 aa32.4■■■□□ 2.78
E2F4-210ENST00000568485 STAC3Q96MF2 364 aa32.4■■■□□ 2.78
E2F4-210ENST00000568485 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
E2F4-210ENST00000568485 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
E2F4-210ENST00000568485 HRCP23327 699 aa32.39■■■□□ 2.78
E2F4-210ENST00000568485 ALS2Q96Q42 1657 aa32.37■■■□□ 2.77
E2F4-210ENST00000568485 EP400Q96L91 3159 aa32.36■■■□□ 2.77
E2F4-210ENST00000568485 WASLO00401 505 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
E2F4-210ENST00000568485 FAM83GA6ND36 823 aa32.34■■■□□ 2.77
E2F4-210ENST00000568485 SEPT12Q8IYM1 358 aa32.34■■■□□ 2.77
E2F4-210ENST00000568485 BRWD3Q6RI45 1802 aa32.34■■■□□ 2.77
E2F4-210ENST00000568485 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
E2F4-210ENST00000568485 GPRASP1Q5JY77 1395 aa32.33■■■□□ 2.77
E2F4-210ENST00000568485 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
E2F4-210ENST00000568485 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
E2F4-210ENST00000568485 ZRANB1Q9UGI0 708 aa32.31■■■□□ 2.76
E2F4-210ENST00000568485 NRAPQ86VF7 1730 aa32.31■■■□□ 2.76
E2F4-210ENST00000568485 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
E2F4-210ENST00000568485 ATP7BP35670 1465 aa32.28■■■□□ 2.76
E2F4-210ENST00000568485 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa32.26■■■□□ 2.76
E2F4-210ENST00000568485 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
E2F4-210ENST00000568485 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.6 ms