RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
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CS-228ENST00000551473 CLTCL1P53675 1640 aa18.15■□□□□ 0.5
CS-228ENST00000551473 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa18.15■□□□□ 0.5
CS-228ENST00000551473 BCL9LQ86UU0 1499 aa18.14■□□□□ 0.5
CS-228ENST00000551473 ESCO1Q5FWF5 840 aa18.14■□□□□ 0.49
CS-228ENST00000551473 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
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CS-228ENST00000551473 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
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CS-228ENST00000551473 FOXO3O43524 673 aa18.08■□□□□ 0.48
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CS-228ENST00000551473 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
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CS-228ENST00000551473 SLIT2O94813 1529 aa18.04■□□□□ 0.48
CS-228ENST00000551473 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
CS-228ENST00000551473 EP400Q96L91 3159 aa18.03■□□□□ 0.48
CS-228ENST00000551473 CCDC144AA2RUR9 1427 aa18.03■□□□□ 0.48
CS-228ENST00000551473 NAIPQ13075 1403 aa18.03■□□□□ 0.48
CS-228ENST00000551473 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa18.02■□□□□ 0.48
CS-228ENST00000551473 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
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CS-228ENST00000551473 TECPR2O15040 1411 aa18■□□□□ 0.47
CS-228ENST00000551473 VPS72Q15906 364 aa18■□□□□ 0.47
CS-228ENST00000551473 DEFB132Q7Z7B7 95 aa18■□□□□ 0.47
CS-228ENST00000551473 SEPT12Q8IYM1 358 aa18■□□□□ 0.47
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CS-228ENST00000551473 PSME1Q06323 249 aa17.98■□□□□ 0.47
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CS-228ENST00000551473 PPLO60437 1756 aa17.98■□□□□ 0.47
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CS-228ENST00000551473 ABCC11Q96J66 1382 aa17.97■□□□□ 0.47
CS-228ENST00000551473 BAG6P46379 1132 aa17.97■□□□□ 0.47
CS-228ENST00000551473 KRT28Q7Z3Y7 464 aa17.97■□□□□ 0.47
CS-228ENST00000551473 KRT27Q7Z3Y8 459 aa17.97■□□□□ 0.47
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CS-228ENST00000551473 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CS-228ENST00000551473 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CS-228ENST00000551473 WAPLQ7Z5K2 1190 aa17.95■□□□□ 0.46
CS-228ENST00000551473 TNS3Q68CZ2 1445 aa17.95■□□□□ 0.46
CS-228ENST00000551473 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa17.94■□□□□ 0.46
CS-228ENST00000551473 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa17.93■□□□□ 0.46
CS-228ENST00000551473 ARHGEF10O15013 1369 aa17.92■□□□□ 0.46
CS-228ENST00000551473 KNDC1Q76NI1 1749 aa17.92■□□□□ 0.46
CS-228ENST00000551473 FMN2Q9NZ56 1722 aa17.92■□□□□ 0.46
CS-228ENST00000551473 SBNO1A3KN83 1393 aa17.91■□□□□ 0.46
CS-228ENST00000551473 BRWD3Q6RI45 1802 aa17.91■□□□□ 0.46
CS-228ENST00000551473 A0A0G2JS52 829 aa17.91■□□□□ 0.46
CS-228ENST00000551473 MYT1Q01538 1121 aa17.91■□□□□ 0.46
CS-228ENST00000551473 SIRT1Q96EB6 747 aa17.91■□□□□ 0.46
CS-228ENST00000551473 PHF8Q9UPP1 1060 aa17.91■□□□□ 0.46
CS-228ENST00000551473 NWD2Q9ULI1 1742 aa17.91■□□□□ 0.46
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CS-228ENST00000551473 LMOD2Q6P5Q4 547 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-228ENST00000551473 PLCH1Q4KWH8 1693 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-228ENST00000551473 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CS-228ENST00000551473 TMEM132EQ6IEE7 984 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-228ENST00000551473 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CS-228ENST00000551473 CABLES1Q8TDN4 633 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-228ENST00000551473 PIK3C2GO75747 1445 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-228ENST00000551473 NRXN1Q9ULB1 1477 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-228ENST00000551473 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-228ENST00000551473 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CS-228ENST00000551473 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
CS-228ENST00000551473 FAM83GA6ND36 823 aa17.83■□□□□ 0.44
CS-228ENST00000551473 PLEKHG5O94827 1062 aa17.83■□□□□ 0.44
CS-228ENST00000551473 ANKARQ7Z5J8 1434 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-228ENST00000551473 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CS-228ENST00000551473 BTG4Q9NY30 223 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-228ENST00000551473 IFT172Q9UG01 1749 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-228ENST00000551473 DISP2A7MBM2 1401 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-228ENST00000551473 RGPD1P0DJD0 1748 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-228ENST00000551473 ABCA3Q99758 1704 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-228ENST00000551473 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CS-228ENST00000551473 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
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CS-228ENST00000551473 NRAPQ86VF7 1730 aa17.78■□□□□ 0.44
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CS-228ENST00000551473 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa17.77■□□□□ 0.44
CS-228ENST00000551473 PRAM1Q96QH2 718 aa17.77■□□□□ 0.44
CS-228ENST00000551473 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
CS-228ENST00000551473 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa17.76■□□□□ 0.43
CS-228ENST00000551473 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa17.76■□□□□ 0.43
CS-228ENST00000551473 POGKQ9P215 609 aa17.76■□□□□ 0.43
CS-228ENST00000551473 ADGRB2O60241 1585 aa17.75■□□□□ 0.43
CS-228ENST00000551473 PARD3Q8TEW0 1356 aa17.75■□□□□ 0.43
CS-228ENST00000551473 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
CS-228ENST00000551473 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP17.74■□□□□ 0.43
CS-228ENST00000551473 MPHOSPH9Q99550 1183 aa17.74■□□□□ 0.43
CS-228ENST00000551473 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
CS-228ENST00000551473 DLC1Q96QB1 1528 aa17.73■□□□□ 0.43
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