RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 MYOM2P54296 1465 aa24.7■■□□□ 1.55
CASP9-211ENST00000546969 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
CASP9-211ENST00000546969 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.7■■□□□ 1.54
CASP9-211ENST00000546969 POTEAQ6S8J7 498 aa24.7■■□□□ 1.54
CASP9-211ENST00000546969 SIRT1Q96EB6 747 aa24.7■■□□□ 1.54
CASP9-211ENST00000546969 ORAI2Q96SN7 254 aa24.7■■□□□ 1.54
CASP9-211ENST00000546969 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.7■■□□□ 1.54
CASP9-211ENST00000546969 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.68■■□□□ 1.54
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CASP9-211ENST00000546969 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.67■■□□□ 1.54
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CASP9-211ENST00000546969 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.66■■□□□ 1.54
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CASP9-211ENST00000546969 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.64■■□□□ 1.54
CASP9-211ENST00000546969 POGKQ9P215 609 aa24.64■■□□□ 1.54
CASP9-211ENST00000546969 LRP6O75581 1613 aa24.63■■□□□ 1.53
CASP9-211ENST00000546969 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CASP9-211ENST00000546969 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.62■■□□□ 1.53
CASP9-211ENST00000546969 NUTM2FA1L443 756 aa24.61■■□□□ 1.53
CASP9-211ENST00000546969 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.59■■□□□ 1.53
CASP9-211ENST00000546969 PRAM1Q96QH2 718 aa24.59■■□□□ 1.53
CASP9-211ENST00000546969 FOXO3O43524 673 aa24.58■■□□□ 1.53
CASP9-211ENST00000546969 C8orf37Q96NL8 207 aa24.58■■□□□ 1.53
CASP9-211ENST00000546969 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
CASP9-211ENST00000546969 AFF2P51816 1311 aa24.57■■□□□ 1.52
CASP9-211ENST00000546969 RXRBP28702 533 aa24.56■■□□□ 1.52
CASP9-211ENST00000546969 ADAMTS2O95450 1211 aa24.55■■□□□ 1.52
CASP9-211ENST00000546969 NGLY1Q96IV0 654 aa24.55■■□□□ 1.52
CASP9-211ENST00000546969 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.54■■□□□ 1.52
CASP9-211ENST00000546969 DLC1Q96QB1 1528 aa24.52■■□□□ 1.52
CASP9-211ENST00000546969 PSME1Q06323 249 aa24.52■■□□□ 1.52
CASP9-211ENST00000546969 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CASP9-211ENST00000546969 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.5■■□□□ 1.51
CASP9-211ENST00000546969 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.49■■□□□ 1.51
CASP9-211ENST00000546969 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CASP9-211ENST00000546969 KIF1AQ12756 1690 aa24.48■■□□□ 1.51
CASP9-211ENST00000546969 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.48■■□□□ 1.51
CASP9-211ENST00000546969 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CASP9-211ENST00000546969 PXDNQ92626 1479 aa24.46■■□□□ 1.51
CASP9-211ENST00000546969 ADGRB1O14514 1584 aa24.45■■□□□ 1.5
CASP9-211ENST00000546969 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CASP9-211ENST00000546969 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CASP9-211ENST00000546969 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CASP9-211ENST00000546969 USP21Q9UK80 565 aa24.44■■□□□ 1.5
CASP9-211ENST00000546969 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CASP9-211ENST00000546969 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.43■■□□□ 1.5
CASP9-211ENST00000546969 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.42■■□□□ 1.5
CASP9-211ENST00000546969 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CASP9-211ENST00000546969 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CASP9-211ENST00000546969 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.4■■□□□ 1.5
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CASP9-211ENST00000546969 ADGRB2O60241 1585 aa24.37■■□□□ 1.49
CASP9-211ENST00000546969 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
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CASP9-211ENST00000546969 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.32■■□□□ 1.48
CASP9-211ENST00000546969 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.31■■□□□ 1.48
CASP9-211ENST00000546969 PLEKHG5O94827 1062 aa24.3■■□□□ 1.48
CASP9-211ENST00000546969 NEUROD1Q13562 356 aa24.3■■□□□ 1.48
CASP9-211ENST00000546969 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CASP9-211ENST00000546969 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.28■■□□□ 1.48
CASP9-211ENST00000546969 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CASP9-211ENST00000546969 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CASP9-211ENST00000546969 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CASP9-211ENST00000546969 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.27■■□□□ 1.48
CASP9-211ENST00000546969 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
CASP9-211ENST00000546969 CDK19Q9BWU1 502 aa24.27■■□□□ 1.48
CASP9-211ENST00000546969 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.26■■□□□ 1.47
CASP9-211ENST00000546969 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.26■■□□□ 1.47
CASP9-211ENST00000546969 ATRNO75882 1429 aa24.26■■□□□ 1.47
CASP9-211ENST00000546969 USP32Q8NFA0 1604 aa24.25■■□□□ 1.47
CASP9-211ENST00000546969 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.25■■□□□ 1.47
CASP9-211ENST00000546969 RGS12O14924 1447 aa24.25■■□□□ 1.47
CASP9-211ENST00000546969 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.24■■□□□ 1.47
CASP9-211ENST00000546969 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CASP9-211ENST00000546969 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CASP9-211ENST00000546969 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.23■■□□□ 1.47
CASP9-211ENST00000546969 ITSN1Q15811 1721 aa24.22■■□□□ 1.47
CASP9-211ENST00000546969 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.21■■□□□ 1.47
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CASP9-211ENST00000546969 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.2■■□□□ 1.46
CASP9-211ENST00000546969 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CASP9-211ENST00000546969 SLIT2O94813 1529 aa24.17■■□□□ 1.46
CASP9-211ENST00000546969 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CASP9-211ENST00000546969 ATP7BP35670 1465 aa24.17■■□□□ 1.46
CASP9-211ENST00000546969 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CASP9-211ENST00000546969 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CASP9-211ENST00000546969 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.14■■□□□ 1.45
CASP9-211ENST00000546969 VPS72Q15906 364 aa24.14■■□□□ 1.45
CASP9-211ENST00000546969 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.14■■□□□ 1.45
CASP9-211ENST00000546969 ACEP12821 1306 aa24.13■■□□□ 1.45
CASP9-211ENST00000546969 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
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