RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537143.5

ATG16L2-208, Transcript of autophagy related 16 like 2, human

TSL 2

Gene ATG16L2, Length 519 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG16L2-208	ENST00000537143	STK26	Q9P289	416 aa		33.76	■■■□□ 2.99
ATG16L2-208	ENST00000537143	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	33.76	■■■□□ 2.99
ATG16L2-208	ENST00000537143	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		33.74	■■■□□ 2.99
ATG16L2-208	ENST00000537143	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
ATG16L2-208	ENST00000537143	HRC	P23327	699 aa		33.72	■■■□□ 2.99
ATG16L2-208	ENST00000537143	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		33.7	■■■□□ 2.99
ATG16L2-208	ENST00000537143	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	33.7	■■■□□ 2.99
ATG16L2-208	ENST00000537143	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
ATG16L2-208	ENST00000537143	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
ATG16L2-208	ENST00000537143	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
ATG16L2-208	ENST00000537143	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
ATG16L2-208	ENST00000537143	ADGRB1	O14514	1584 aa		33.64	■■■□□ 2.98
ATG16L2-208	ENST00000537143	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
ATG16L2-208	ENST00000537143	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		33.64	■■■□□ 2.98
ATG16L2-208	ENST00000537143	SIRT1	Q96EB6	747 aa		33.62	■■■□□ 2.97
ATG16L2-208	ENST00000537143	PXDN	Q92626	1479 aa		33.62	■■■□□ 2.97
ATG16L2-208	ENST00000537143	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
ATG16L2-208	ENST00000537143	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		33.57	■■■□□ 2.96
ATG16L2-208	ENST00000537143	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
ATG16L2-208	ENST00000537143	NUTM2F	A1L443	756 aa		33.56	■■■□□ 2.96
ATG16L2-208	ENST00000537143	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	33.56	■■■□□ 2.96
ATG16L2-208	ENST00000537143	DLC1	Q96QB1	1528 aa		33.56	■■■□□ 2.96
ATG16L2-208	ENST00000537143	AFF2	P51816	1311 aa		33.53	■■■□□ 2.96
ATG16L2-208	ENST00000537143	FOXO3	O43524	673 aa		33.51	■■■□□ 2.95
ATG16L2-208	ENST00000537143	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		33.51	■■■□□ 2.95
ATG16L2-208	ENST00000537143	PRAM1	Q96QH2	718 aa		33.5	■■■□□ 2.95
ATG16L2-208	ENST00000537143	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
ATG16L2-208	ENST00000537143	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		33.49	■■■□□ 2.95
ATG16L2-208	ENST00000537143	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		33.48	■■■□□ 2.95
ATG16L2-208	ENST00000537143	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
ATG16L2-208	ENST00000537143	C8orf37	Q96NL8	207 aa		33.47	■■■□□ 2.95
ATG16L2-208	ENST00000537143	ADGRB2	O60241	1585 aa		33.47	■■■□□ 2.95
ATG16L2-208	ENST00000537143	KIF1A	Q12756	1690 aa		33.46	■■■□□ 2.95
ATG16L2-208	ENST00000537143	USP32	Q8NFA0	1604 aa		33.46	■■■□□ 2.95
ATG16L2-208	ENST00000537143	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	33.45	■■■□□ 2.95
ATG16L2-208	ENST00000537143	ADAMTS2	O95450	1211 aa		33.44	■■■□□ 2.94
ATG16L2-208	ENST00000537143	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
ATG16L2-208	ENST00000537143	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		33.4	■■■□□ 2.94
ATG16L2-208	ENST00000537143	RXRB	P28702	533 aa		33.39	■■■□□ 2.94
ATG16L2-208	ENST00000537143	STAC3	Q96MF2	364 aa		33.38	■■■□□ 2.93
ATG16L2-208	ENST00000537143	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		33.35	■■■□□ 2.93
ATG16L2-208	ENST00000537143	POGK	Q9P215	609 aa		33.35	■■■□□ 2.93
ATG16L2-208	ENST00000537143	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
ATG16L2-208	ENST00000537143	NGLY1	Q96IV0	654 aa		33.34	■■■□□ 2.93
ATG16L2-208	ENST00000537143	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		33.34	■■■□□ 2.93
ATG16L2-208	ENST00000537143	RGS12	O14924	1447 aa		33.34	■■■□□ 2.93
ATG16L2-208	ENST00000537143	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		33.34	■■■□□ 2.93
ATG16L2-208	ENST00000537143	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
ATG16L2-208	ENST00000537143	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
ATG16L2-208	ENST00000537143	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
ATG16L2-208	ENST00000537143	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		33.31	■■■□□ 2.92
ATG16L2-208	ENST00000537143	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		33.31	■■■□□ 2.92
ATG16L2-208	ENST00000537143	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
ATG16L2-208	ENST00000537143	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
ATG16L2-208	ENST00000537143	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		33.28	■■■□□ 2.92
ATG16L2-208	ENST00000537143	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		33.27	■■■□□ 2.92
ATG16L2-208	ENST00000537143	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
ATG16L2-208	ENST00000537143	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		33.27	■■■□□ 2.92
ATG16L2-208	ENST00000537143	ATRN	O75882	1429 aa		33.27	■■■□□ 2.92
ATG16L2-208	ENST00000537143	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		33.26	■■■□□ 2.92
ATG16L2-208	ENST00000537143	USP21	Q9UK80	565 aa		33.25	■■■□□ 2.91
ATG16L2-208	ENST00000537143	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	33.24	■■■□□ 2.91
ATG16L2-208	ENST00000537143	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
ATG16L2-208	ENST00000537143	SBNO1	A3KN83	1393 aa		33.23	■■■□□ 2.91
ATG16L2-208	ENST00000537143	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
ATG16L2-208	ENST00000537143	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ATG16L2-208	ENST00000537143	ABCA3	Q99758	1704 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ATG16L2-208	ENST00000537143	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		33.19	■■■□□ 2.9
ATG16L2-208	ENST00000537143	SLIT2	O94813	1529 aa		33.18	■■■□□ 2.9
ATG16L2-208	ENST00000537143	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
ATG16L2-208	ENST00000537143	ATP7B	P35670	1465 aa		33.18	■■■□□ 2.9
ATG16L2-208	ENST00000537143	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		33.16	■■■□□ 2.9
ATG16L2-208	ENST00000537143	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
ATG16L2-208	ENST00000537143	PSME1	Q06323	249 aa		33.15	■■■□□ 2.9
ATG16L2-208	ENST00000537143	ALS2	Q96Q42	1657 aa		33.15	■■■□□ 2.9
ATG16L2-208	ENST00000537143	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
ATG16L2-208	ENST00000537143	ARHGEF10	O15013	1369 aa		33.1	■■■□□ 2.89
ATG16L2-208	ENST00000537143	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		33.1	■■■□□ 2.89
ATG16L2-208	ENST00000537143	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		33.09	■■■□□ 2.89
ATG16L2-208	ENST00000537143	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		33.09	■■■□□ 2.89
ATG16L2-208	ENST00000537143	GLI3	P10071	1580 aa		33.09	■■■□□ 2.89
ATG16L2-208	ENST00000537143	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		33.07	■■■□□ 2.88
ATG16L2-208	ENST00000537143	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		33.07	■■■□□ 2.88
ATG16L2-208	ENST00000537143	ITSN1	Q15811	1721 aa		33.06	■■■□□ 2.88
ATG16L2-208	ENST00000537143	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		33.05	■■■□□ 2.88
ATG16L2-208	ENST00000537143	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
ATG16L2-208	ENST00000537143	PLEKHG5	O94827	1062 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ATG16L2-208	ENST00000537143	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ATG16L2-208	ENST00000537143	CDK19	Q9BWU1	502 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ATG16L2-208	ENST00000537143	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ATG16L2-208	ENST00000537143	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
ATG16L2-208	ENST00000537143	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		33.02	■■■□□ 2.88
ATG16L2-208	ENST00000537143	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		33	■■■□□ 2.87
ATG16L2-208	ENST00000537143	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		33	■■■□□ 2.87
ATG16L2-208	ENST00000537143	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
ATG16L2-208	ENST00000537143	FAM83G	A6ND36	823 aa		32.98	■■■□□ 2.87
ATG16L2-208	ENST00000537143	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
ATG16L2-208	ENST00000537143	NRAP	Q86VF7	1730 aa		32.97	■■■□□ 2.87
ATG16L2-208	ENST00000537143	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
ATG16L2-208	ENST00000537143	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		32.94	■■■□□ 2.86

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